66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2035 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2035  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 
107 aa  218  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3014  hypothetical protein  81.9 
 
 
105 aa  177  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2228  hypothetical protein  81.9 
 
 
105 aa  177  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.643872  hitchhiker  0.00000000152777 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2814  PadR-like family transcriptional regulator  81.9 
 
 
105 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3051  hypothetical protein  80.95 
 
 
105 aa  176  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.492202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3015  hypothetical protein  80 
 
 
105 aa  174  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2802  hypothetical protein  80 
 
 
105 aa  174  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.265307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2734  PadR family transcriptional regulator  80 
 
 
135 aa  173  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3013  hypothetical protein  80 
 
 
105 aa  174  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00968933 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3051  hypothetical protein  79.05 
 
 
105 aa  173  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2753  PadR family transcriptional regulator  79.05 
 
 
105 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00113864  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2032  hypothetical protein  46 
 
 
111 aa  97.1  7e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0901  PadR family transcriptional regulator  46.46 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000161426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0885  PadR family transcriptional regulator  46.46 
 
 
108 aa  92  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0982  hypothetical protein  46.46 
 
 
104 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.349108  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0917  hypothetical protein  46.46 
 
 
108 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0882  PadR-like family transcriptional regulator  46.94 
 
 
104 aa  92  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4283  hypothetical protein  46.46 
 
 
104 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150167  normal  0.0390672 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1073  hypothetical protein  46.46 
 
 
104 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1491  PadR family transcriptional regulator  50 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1147  transcriptional regulator, PadR family  46.39 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0295  PadR family transcriptional regulator  48.94 
 
 
115 aa  88.2  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0209  transcriptional regulator, PadR-like family  42.71 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0210423 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1906  transcriptional regulator, PadR-like family  43.3 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000539053 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1678  transcriptional regulator, PadR-like family  42.7 
 
 
106 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2194  transcriptional regulator, PadR-like family  45.65 
 
 
106 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1175  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00041601  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3164  PadR-like family transcriptional regulator  40.62 
 
 
110 aa  79  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04800  transcriptional regulator, PadR family  38.54 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17520  transcriptional regulator, PadR family  37.62 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311111  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1369  transcriptional regulator, PadR-like family  41.05 
 
 
113 aa  72  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16972  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2490  transcriptional regulator, PadR-like family  37.76 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  39.39 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35110  predicted transcriptional regulator  34.69 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2956  PadR family transcriptional regulator  42.05 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216543  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  38 
 
 
109 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  38.14 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  34 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  32.67 
 
 
114 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  35.35 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  39.77 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8548  PadR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
117 aa  52  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3679  PadR-like family transcriptional regulator  30.69 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72711  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3047  PadR-like family transcriptional regulator  30.69 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1707  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.224855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  32.32 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4120  PadR-like family transcriptional regulator  30.39 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
213 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
220 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
220 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  34.07 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  31.18 
 
 
316 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  31.65 
 
 
112 aa  42.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1146  transcriptional regulator, PadR-like family  26.8 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1058  transcriptional regulator, PadR family  41.07 
 
 
57 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.53908e-38 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1057  hypothetical protein  52.94 
 
 
38 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.490589999999999e-38 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0311  PadR-like family transcriptional regulator  28.26 
 
 
138 aa  42.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1475  transcriptional regulator, PadR-like family  32.18 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  34.33 
 
 
183 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3409  transcriptional regulator, PadR-like family  33.78 
 
 
104 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  31.94 
 
 
255 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  36.36 
 
 
215 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2546  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
214 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  35.59 
 
 
263 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  27.85 
 
 
230 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  36.21 
 
 
250 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>