161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3409 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3409  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 104 aa  200  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  59.79 
 
 		 118 aa  106  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  53.85 
 
 		 117 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 132 aa  98.6  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3047  PadR-like family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 119 aa  93.6  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  48.48 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3679  PadR-like family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72711  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1475  transcriptional regulator, PadR-like family  52.53 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  48.04 
 
 		 114 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  53 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1146  transcriptional regulator, PadR-like family  59.04 
 
 		 119 aa  88.2  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1707  transcriptional regulator, PadR-like family  51.32 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.224855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4120  PadR-like family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8548  PadR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35110  predicted transcriptional regulator  45.98 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04800  transcriptional regulator, PadR family  40.66 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1175  transcriptional regulator, PadR-like family  39.77 
 
 		 113 aa  67  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00041601  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0209  transcriptional regulator, PadR-like family  34.95 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0210423 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1491  PadR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2956  PadR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2490  transcriptional regulator, PadR-like family  36.27 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0901  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000161426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1073  hypothetical protein  35 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0917  hypothetical protein  35 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0885  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0982  hypothetical protein  35 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.349108  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4283  hypothetical protein  35 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150167  normal  0.0390672 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1147  transcriptional regulator, PadR family  37.36 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0295  PadR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  36.99 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1906  transcriptional regulator, PadR-like family  43.68 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000539053 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  41.76 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  37.23 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0882  PadR-like family transcriptional regulator  34 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2194  transcriptional regulator, PadR-like family  37.23 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  41 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  41 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  40.23 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  30.61 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2032  hypothetical protein  35.05 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2753  PadR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00113864  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3051  hypothetical protein  33.67 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2802  hypothetical protein  33.67 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.265307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3015  hypothetical protein  33.67 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2814  PadR-like family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  36.9 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3014  hypothetical protein  33.67 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3051  hypothetical protein  32.65 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.492202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2734  PadR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1921  PadR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  39.44 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17520  transcriptional regulator, PadR family  33.68 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  36.59 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3164  PadR-like family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2228  hypothetical protein  32.35 
 
 		 105 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.643872  hitchhiker  0.00000000152777 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3013  hypothetical protein  33.67 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00968933 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  36.9 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  41.89 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  41.33 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  37.14 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  37.65 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  32.89 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1857  PadR-like family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0870  transcriptional regulator, PadR-like family  38.57 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.126206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3472  PadR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2035  PadR-like family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  30.61 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  41.77 
 
 		 263 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  38.16 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  28.28 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  41.57 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  41.1 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1925  PadR-like family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  29.76 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  38.16 
 
 		 277 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>