112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2956 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2956  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 105 aa  209  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1906  transcriptional regulator, PadR-like family  47.78 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000539053 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0209  transcriptional regulator, PadR-like family  43.68 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0210423 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0295  PadR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1491  PadR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2032  hypothetical protein  38.95 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2490  transcriptional regulator, PadR-like family  38.71 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17520  transcriptional regulator, PadR family  37.25 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2194  transcriptional regulator, PadR-like family  40.43 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  37.5 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0882  PadR-like family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140033  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0917  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0901  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000161426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0885  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1707  transcriptional regulator, PadR-like family  49.35 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.224855 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0982  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.349108  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  41 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1073  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3047  PadR-like family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1147  transcriptional regulator, PadR family  40 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4283  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150167  normal  0.0390672 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3679  PadR-like family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72711  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04800  transcriptional regulator, PadR family  38.2 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2802  hypothetical protein  42.39 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.265307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3015  hypothetical protein  42.39 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2814  PadR-like family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1175  transcriptional regulator, PadR-like family  40.23 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00041601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3051  hypothetical protein  43.18 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.492202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2734  PadR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3051  hypothetical protein  42.39 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3014  hypothetical protein  42.39 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2228  hypothetical protein  43.18 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.643872  hitchhiker  0.00000000152777 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2753  PadR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00113864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3013  hypothetical protein  42.39 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00968933 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2035  PadR-like family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  40.66 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1475  transcriptional regulator, PadR-like family  38.64 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  39.33 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3409  transcriptional regulator, PadR-like family  35.96 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8548  PadR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4120  PadR-like family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3164  PadR-like family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1146  transcriptional regulator, PadR-like family  34.88 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  37.93 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35110  predicted transcriptional regulator  33.7 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1507  transcriptional regulator, PadR-like family  37.68 
 
 		 175 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 191 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  36.11 
 
 		 191 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1369  transcriptional regulator, PadR-like family  28.57 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16972  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  37.36 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  42.11 
 
 		 255 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 109 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  34.83 
 
 		 195 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3472  PadR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 226 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 226 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 226 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  41.03 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  38.67 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 203 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 212 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  38.24 
 
 		 210 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  34.78 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  50 
 
 		 271 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 200 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1857  PadR-like family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  38.24 
 
 		 180 aa  43.5  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1018  PadR-like family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1242  PadR-like family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 218 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000724616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  31.43 
 
 		 121 aa  42.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  35.56 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 372 aa  42  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  48.89 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  35.37 
 
 		 211 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  48.89 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 110 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 213 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 156 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0782  PadR-like family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 152 aa  41.6  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.661391  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 152 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  32.05 
 
 		 114 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 201 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  38.24 
 
 		 263 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 236 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  27 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1678  transcriptional regulator, PadR-like family  29.55 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  36.99 
 
 		 277 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  34.09 
 
 		 224 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3227  PadR-like family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 195 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.381918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 210 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  29.35 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>