91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2490 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2490  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 112 aa  228  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0209  transcriptional regulator, PadR-like family  48 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0210423 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17520  transcriptional regulator, PadR family  49.52 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04800  transcriptional regulator, PadR family  43.3 
 
 		 123 aa  95.9  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0295  PadR family transcriptional regulator  50 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1906  transcriptional regulator, PadR-like family  47.19 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000539053 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2032  hypothetical protein  43.62 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1175  transcriptional regulator, PadR-like family  42.05 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00041601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0882  PadR-like family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140033  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0901  PadR family transcriptional regulator  38 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000161426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0982  hypothetical protein  38 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.349108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0885  PadR family transcriptional regulator  38 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0917  hypothetical protein  38 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1073  hypothetical protein  38 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4283  hypothetical protein  38 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150167  normal  0.0390672 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1147  transcriptional regulator, PadR family  38.78 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2753  PadR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00113864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2802  hypothetical protein  38.78 
 
 		 105 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.265307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3015  hypothetical protein  38.78 
 
 		 105 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3051  hypothetical protein  38.78 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2734  PadR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3013  hypothetical protein  37.76 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00968933 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2814  PadR-like family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3014  hypothetical protein  37.76 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2956  PadR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216543  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3051  hypothetical protein  36.73 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.492202  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1491  PadR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2228  hypothetical protein  36.73 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.643872  hitchhiker  0.00000000152777 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2035  PadR-like family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2194  transcriptional regulator, PadR-like family  37.36 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3047  PadR-like family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3679  PadR-like family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72711  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  40.91 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1678  transcriptional regulator, PadR-like family  36.9 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4120  PadR-like family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  36.36 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1369  transcriptional regulator, PadR-like family  28.7 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16972  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  37.35 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3164  PadR-like family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3409  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  39.29 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  34.09 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1146  transcriptional regulator, PadR-like family  34.94 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35110  predicted transcriptional regulator  33.73 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1475  transcriptional regulator, PadR-like family  35.63 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  31.87 
 
 		 203 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8548  PadR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1707  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.224855 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4572  PadR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  28.74 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1087  PadR-like family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  33.72 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1057  PadR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 181 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4987  PadR-like family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 237 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  31.52 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4355  PadR-like family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371852 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5307  PadR-like family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 250 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3130  PadR-like family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 237 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 208 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5141  PadR-like family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 237 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244499  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4521  PadR-like family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 237 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3162  PadR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 236 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5718  PadR-like family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 237 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86173  normal  0.252047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 119 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1098  PadR-like family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 181 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.216996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  30.86 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 226 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 226 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 226 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3926  transcriptional regulator PadR-like  32.84 
 
 		 196 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.171272 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  32.58 
 
 		 197 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>