More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1284 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 121 aa  246  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  36.19 
 
 		 116 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 114 aa  87.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  35.24 
 
 		 114 aa  83.6  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 111 aa  80.1  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  37.14 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  39.18 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  33.98 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  33.66 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  36.89 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 188 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  32.67 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1857  PadR-like family transcriptional regulator  32 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  33.98 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  38.68 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 121 aa  67  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  34.58 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  32 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  34.41 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  27.62 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  34.31 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  35.05 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  35.64 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  36.14 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  33 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  33 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  32 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  33.67 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2081  transcriptional regulator, PadR-like family  29.79 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000022052  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  31.73 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  36.27 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  30 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  35.11 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8856  transcriptional regulator, PadR family  37.74 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679523  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  37.38 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  37.38 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  32.5 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1707  PadR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.28683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3472  PadR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3153  PadR-like family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  34.02 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  37.38 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  38.2 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  37.38 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  31 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0870  transcriptional regulator, PadR-like family  34 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.126206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  28.04 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  32.04 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  37.8 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  30 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  36.79 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  34.83 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  36.79 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  36.79 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  36.26 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1507  transcriptional regulator, PadR-like family  40.79 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>