266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0345 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 116 aa  235  2e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  48.62 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  50 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  45 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0870  transcriptional regulator, PadR-like family  44.23 
 
 		 109 aa  96.7  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.126206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  42.31 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2081  transcriptional regulator, PadR-like family  42.72 
 
 		 109 aa  90.1  9e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000022052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 109 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  36.54 
 
 		 109 aa  84  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1921  PadR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  33.65 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  36.08 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  31.73 
 
 		 110 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  28.32 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  30.19 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  32.04 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  35.79 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  27.84 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2361  PadR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24890  predicted transcriptional regulator  30.28 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134259  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  35.37 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  32.38 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  36.79 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  30.48 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  37.65 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  32.99 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  29.36 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  31.25 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  34.69 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  31.18 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0819  transcriptional regulator, PadR-like family  30.85 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.886825  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  25 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  30.69 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  33.75 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  29.31 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  31.37 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  30 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  32.04 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  32.99 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09510  transcriptional regulator, PadR family  28 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  25.51 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  32.1 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  28 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1070  transcriptional regulator, PadR-like family  32.65 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188637  hitchhiker  0.000000498444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0895  transcriptional regulator PadR family protein  25.93 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  25 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  27.45 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1707  transcriptional regulator, PadR-like family  34.18 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.224855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  29.35 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  30 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  36.14 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  28.87 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  28.87 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  31.68 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3780  transcriptional regulator, PadR family  31.07 
 
 		 108 aa  52  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0742647  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  28.87 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 121 aa  52  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  30 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  29 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  29.67 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>