More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4394 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 119 aa  244  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  53.21 
 
 		 110 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1857  PadR-like family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 109 aa  108  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3153  PadR-like family transcriptional regulator  57.32 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 113 aa  104  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 113 aa  103  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1707  PadR family transcriptional regulator  50.46 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.28683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 134 aa  99.4  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3603  PadR family transcriptional regulator  50 
 
 		 113 aa  99.4  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 111 aa  90.9  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  37.61 
 
 		 116 aa  90.9  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  38.38 
 
 		 110 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  36.27 
 
 		 109 aa  87  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 109 aa  87  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 188 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3472  PadR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  36.63 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  38.39 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  37.86 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  35.14 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  41.58 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  37.25 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1921  PadR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  37.25 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 115 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 110 aa  72  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  35.29 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  36.27 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  36.19 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  41.75 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  36.89 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  31.93 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  32.77 
 
 		 125 aa  67  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  32.38 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  33.66 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  32.04 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  32.04 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  32.38 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  32.38 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  32.04 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  32.04 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2081  transcriptional regulator, PadR-like family  31.37 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000022052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  30.84 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  34.65 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  32.04 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  39.81 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  34.58 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  34.55 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  35.56 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1194  transcriptional regulator, PadR-like family  30.28 
 
 		 111 aa  62  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  30.09 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0819  transcriptional regulator, PadR-like family  28.83 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.886825  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0870  transcriptional regulator, PadR-like family  30.1 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.126206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  36.17 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  28.87 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>