More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8234 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 123 aa  239  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  51.33 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  55.56 
 
 		 115 aa  116  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  50.94 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  52.43 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  49.55 
 
 		 111 aa  114  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  56.07 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  58.25 
 
 		 113 aa  106  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 108 aa  88.6  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  33.64 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  32.67 
 
 		 109 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  42.71 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 109 aa  84.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 188 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 111 aa  84  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  43.14 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  29.7 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  36.79 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  33.96 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  30.48 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  36.56 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  38.89 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  32.77 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  39.25 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1857  PadR-like family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  32.69 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3472  PadR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 110 aa  72  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  38.38 
 
 		 117 aa  72  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  31.19 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1921  PadR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  42.31 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  34.65 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  41 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  32.46 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  32.41 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  32.67 
 
 		 121 aa  66.6  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  33.01 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24890  predicted transcriptional regulator  34.34 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  33.01 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  31 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  31.3 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  30.56 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.02647e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2859  hypothetical protein  36.19 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000516824  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  33.01 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  31.68 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2081  transcriptional regulator, PadR-like family  28.85 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000022052  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  38 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  37.62 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8856  transcriptional regulator, PadR family  39 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  32.04 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  39.83 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  35 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 110 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2382  transcriptional regulator, PadR-like family  44.83 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000270616 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  32.04 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  37.86 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1858  PadR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000789415  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0734  hypothetical protein  37.21 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  35.85 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3603  PadR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0870  transcriptional regulator, PadR-like family  27.88 
 
 		 109 aa  62  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.126206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  49.3 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  41.46 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  38.78 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>