282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2308 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 124 aa  248  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  62.81 
 
 		 117 aa  140  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  44.72 
 
 		 114 aa  99.4  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3772  transcriptional regulator, PadR-like family  41.23 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  39.83 
 
 		 111 aa  90.1  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  32.46 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  43.21 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  35.29 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  32.18 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  40.7 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  34.12 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  42.03 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  30.43 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  28.7 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2348  PadR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203957  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2060  PadR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  34.12 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1475  transcriptional regulator, PadR-like family  45.16 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  36.25 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  46.88 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 372 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  44.29 
 
 		 277 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  34.91 
 
 		 250 aa  54.3  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  44.07 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  30.34 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  32.93 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4120  PadR-like family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1270  PadR-like family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169455  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  34.57 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0494  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  33.61 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  43.75 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35110  predicted transcriptional regulator  32.58 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  36.14 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  30.49 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  38.57 
 
 		 263 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  38.37 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 189 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  33.67 
 
 		 210 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  32.77 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0318  PadR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.490678  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  26.72 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  31.87 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.02647e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0216  PadR-like family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3696  PadR-like family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 108 aa  50.1  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 110 aa  50.1  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1921  PadR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 114 aa  50.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  38.57 
 
 		 271 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0613  PadR-like family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  35.29 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  38.2 
 
 		 371 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3679  PadR-like family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72711  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3047  PadR-like family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 203 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4325  PadR-like family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  31.36 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13523  hypothetical protein  44.44 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194413 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1858  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000789415  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0681  transcriptional regulator, PadR-like family  34.72 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 188 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  29.46 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  30.25 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  36.62 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  35.56 
 
 		 226 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  38.03 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3409  transcriptional regulator, PadR-like family  39.44 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0691  PadR-like family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>