More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0311 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  305  1.0000000000000001e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  69.68 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  66.24 
 
 		 157 aa  213  8e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0247  PadR-like family transcriptional regulator  69.43 
 
 		 157 aa  198  3e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.917894 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1018  PadR-like family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1327  PadR-like family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00110327  decreased coverage  0.00407043 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  32.19 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  39.02 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3525  PadR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.328828  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02940  predicted transcriptional regulator  41.67 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0630  transcriptional regulator, PadR-like family  41.67 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0629  PadR-like family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3537  PadR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.113716  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4384  transcriptional regulator, PadR family  41.67 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3365  PadR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.230818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3252  PadR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02890  hypothetical protein  41.67 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3507  transcriptional regulator, PadR family  41.67 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  46.84 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  37.21 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03708  hypothetical protein  37.25 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0411  PadR-like family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3954  transcriptional regulator, PadR-like family  34.78 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.564811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4067  transcriptional regulator, PadR-like family  34.78 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.690798 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  36.67 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  34.95 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  30.28 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  30.71 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  28.8 
 
 		 251 aa  61.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  34.65 
 
 		 191 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  41.67 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2866  transcriptional regulator, PadR-like family  28.57 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  38.61 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  39.76 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  31.25 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0038  PadR-like family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3227  PadR-like family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.381918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  40.79 
 
 		 263 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1530  PadR-like family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5307  PadR-like family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 250 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4521  PadR-like family transcriptional regulator  37 
 
 		 237 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  35.62 
 
 		 334 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  38.03 
 
 		 316 aa  57.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5141  PadR-like family transcriptional regulator  37 
 
 		 237 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244499  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5718  PadR-like family transcriptional regulator  37 
 
 		 237 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86173  normal  0.252047 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3162  PadR family transcriptional regulator  37 
 
 		 236 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1415  PadR-like family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 209 aa  57.4  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 220 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 220 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  40.54 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3130  PadR-like family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 237 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1087  PadR-like family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 203 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  35.37 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  36.14 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4987  PadR-like family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 213 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  33.07 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0953  PadR-like family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000151261  hitchhiker  0.000286609 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1371  PadR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  37.84 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  36.47 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0115  PadR-like family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00621123  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  39.18 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3678  transcriptional regulator, PadR-like family  44.29 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1127  transcriptional regulator, PadR-like family  35.92 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  39.24 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4612  PadR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1141  transcriptional regulator, PadR-like family  40.22 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  31.96 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6014  PadR-like family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 325 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  51.06 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0619  PadR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 305 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  48.68 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0868  PadR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.343891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1409  transcriptional regulator protein  30 
 
 		 204 aa  53.9  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  36.08 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  38.82 
 
 		 210 aa  53.9  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2519  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5137  PadR-like family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 254 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.389503  normal  0.327359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  37.65 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>