179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3365 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3365  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 
207 aa  424  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.230818  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02940  predicted transcriptional regulator  99.03 
 
 
207 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0630  transcriptional regulator, PadR-like family  99.03 
 
 
207 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870897  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4384  transcriptional regulator, PadR family  99.03 
 
 
207 aa  422  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02890  hypothetical protein  99.03 
 
 
207 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3252  PadR family transcriptional regulator  99.03 
 
 
207 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0629  PadR-like family transcriptional regulator  99.03 
 
 
207 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3537  PadR family transcriptional regulator  98.07 
 
 
207 aa  417  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.113716  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3507  transcriptional regulator, PadR family  98.55 
 
 
207 aa  419  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3405  transcriptional regulator, PadR family  68.37 
 
 
214 aa  261  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3401  transcriptional regulator, PadR family  68.37 
 
 
214 aa  261  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3475  PadR family transcriptional regulator  68.37 
 
 
214 aa  261  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.108637  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3509  PadR family transcriptional regulator  68.37 
 
 
214 aa  260  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000686547 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3571  PadR family transcriptional regulator  68.37 
 
 
214 aa  260  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.333448 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3525  PadR family transcriptional regulator  75.82 
 
 
181 aa  244  6e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.328828  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  40.44 
 
 
189 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  42.76 
 
 
204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  40.82 
 
 
150 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  38.51 
 
 
152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  37.59 
 
 
203 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1409  transcriptional regulator protein  37.42 
 
 
204 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  36 
 
 
238 aa  103  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  36.18 
 
 
226 aa  102  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  35.62 
 
 
215 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  38.46 
 
 
210 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  37.16 
 
 
226 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  37.16 
 
 
226 aa  97.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  36.3 
 
 
226 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  38.56 
 
 
201 aa  95.5  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3227  PadR-like family transcriptional regulator  32.77 
 
 
195 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.381918  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  34.76 
 
 
200 aa  89.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  32.92 
 
 
194 aa  87.8  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
236 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  31.14 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  44.66 
 
 
176 aa  86.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  33.12 
 
 
196 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  48.89 
 
 
191 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4198  PadR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
247 aa  85.5  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  48.48 
 
 
191 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2546  PadR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1092  PadR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0148193 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4572  PadR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1242  PadR-like family transcriptional regulator  36.24 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000724616  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1087  PadR-like family transcriptional regulator  40.74 
 
 
181 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0024  PadR family transcriptional regulator  45.95 
 
 
235 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5629  transcriptional regulator, PadR-like family  30 
 
 
287 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4355  PadR-like family transcriptional regulator  36.2 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.371852 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0022  PadR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1530  PadR-like family regulatory protein  44.59 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0030  PadR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000428656  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0028  PadR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1174  PadR family transcriptional regulator  47.14 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1454  PadR family transcriptional regulator  47.14 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0027  PadR family transcriptional regulator  47.14 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1057  PadR family transcriptional regulator  39.23 
 
 
181 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4273  PadR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1098  PadR-like family transcriptional regulator  39.23 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.216996 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5137  PadR-like family transcriptional regulator  44.93 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.389503  normal  0.327359 
 
 
-
 
NC_003296  RS03708  hypothetical protein  41.33 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473027  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5141  PadR-like family transcriptional regulator  43.24 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244499  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5718  PadR-like family transcriptional regulator  43.24 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86173  normal  0.252047 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3130  PadR-like family transcriptional regulator  43.24 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4521  PadR-like family transcriptional regulator  43.24 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3162  PadR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4987  PadR-like family transcriptional regulator  43.24 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  41.03 
 
 
250 aa  72  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5307  PadR-like family transcriptional regulator  43.24 
 
 
250 aa  72  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  39.66 
 
 
195 aa  71.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  44.44 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3926  transcriptional regulator PadR-like  33.12 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.171272 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1415  PadR-like family transcriptional regulator  32.39 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2383  transcriptional regulator PadR-like  31.1 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  35.51 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  35.45 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3954  transcriptional regulator, PadR-like family  34.92 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.564811  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4067  transcriptional regulator, PadR-like family  34.92 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.690798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  29.37 
 
 
250 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4192  hypothetical protein  41.3 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  45.71 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1127  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  42.03 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  34.38 
 
 
271 aa  65.5  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  41.67 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  30.82 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  40.19 
 
 
371 aa  64.7  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  32.61 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  32.61 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1141  transcriptional regulator, PadR-like family  43.9 
 
 
151 aa  64.3  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3009  transcriptional regulator, PadR-like  30.85 
 
 
141 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  26.39 
 
 
255 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal 
 
 
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NC_011071  Smal_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  34.15 
 
 
186 aa  62  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
213 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
220 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  39.76 
 
 
206 aa  61.6  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
220 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  37.04 
 
 
230 aa  61.6  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.236404 
 
 
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NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  36.67 
 
 
156 aa  61.6  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal 
 
 
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