230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3199 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 277 aa  528  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  62.25 
 
 		 240 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  53.8 
 
 		 203 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  52 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  50.33 
 
 		 255 aa  135  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  44.44 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6014  PadR-like family transcriptional regulator  49.73 
 
 		 325 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  48.28 
 
 		 316 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0619  PadR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 305 aa  122  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  47.53 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  43.9 
 
 		 230 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 189 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  47.83 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  46.15 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  47.13 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  44.22 
 
 		 271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 220 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  45.75 
 
 		 180 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 220 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 213 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4612  PadR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 234 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  42.47 
 
 		 219 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  43.15 
 
 		 334 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  37.72 
 
 		 195 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  42.96 
 
 		 205 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  39.47 
 
 		 206 aa  95.9  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  35.1 
 
 		 250 aa  85.9  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  41.32 
 
 		 191 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  46.32 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  38.17 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0563  PadR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  70.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  47.44 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  32.64 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  41.41 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3227  PadR-like family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.381918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  44.3 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  33.06 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1087  PadR-like family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1409  transcriptional regulator protein  39.42 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 155 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0257  PadR-like family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 169 aa  64.7  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.688935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2892  PadR-like family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0411  PadR-like family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3130  PadR-like family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4521  PadR-like family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5141  PadR-like family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244499  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5718  PadR-like family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86173  normal  0.252047 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1401  PadR-like family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1507  transcriptional regulator, PadR-like family  44.59 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3162  PadR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4987  PadR-like family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0038  PadR-like family transcriptional regulator  50 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  44.44 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2546  PadR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8287  transcriptional regulator protein-like protein  33.9 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0953  PadR-like family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 141 aa  61.2  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000151261  hitchhiker  0.000286609 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2866  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2382  transcriptional regulator, PadR-like family  41.18 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000270616 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  43.75 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  32.17 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  46.05 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1213  transcriptional regulator, PadR-like family  39.62 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  46.88 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1371  PadR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  43.59 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3678  transcriptional regulator, PadR-like family  38.26 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 111 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1127  transcriptional regulator, PadR-like family  50.77 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2649  PadR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00573866  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1415  PadR-like family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5307  PadR-like family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1327  PadR-like family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 162 aa  57  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00110327  decreased coverage  0.00407043 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4198  PadR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3507  transcriptional regulator, PadR family  37.66 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3537  PadR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.113716  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0630  transcriptional regulator, PadR-like family  37.66 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870897  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>