212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4102 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 277 aa  527  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  52.9 
 
 		 217 aa  145  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  51.02 
 
 		 180 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6014  PadR-like family transcriptional regulator  50 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  46.39 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 203 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  48.28 
 
 		 250 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  50.35 
 
 		 250 aa  132  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  47.34 
 
 		 251 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0619  PadR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  48.57 
 
 		 205 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  44.57 
 
 		 195 aa  118  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4612  PadR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  47.22 
 
 		 316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  43.29 
 
 		 271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  46.99 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 189 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  45.32 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 220 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 220 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  39.73 
 
 		 334 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 213 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 240 aa  109  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  42.36 
 
 		 206 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  46.04 
 
 		 183 aa  101  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 240 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  42.36 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  43.57 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  33.17 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  47.67 
 
 		 191 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  34.1 
 
 		 195 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  44.19 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 176 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1409  transcriptional regulator protein  37.07 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  31.51 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 182 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  44 
 
 		 152 aa  73.9  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 150 aa  71.6  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 150 aa  71.6  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  44 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  37.24 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4355  PadR-like family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3162  PadR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4987  PadR-like family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  32.68 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1127  transcriptional regulator, PadR-like family  43.9 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.272807 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  24.29 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4198  PadR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0022  PadR family transcriptional regulator  50 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1530  PadR-like family regulatory protein  50 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0030  PadR family transcriptional regulator  50 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000428656  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0028  PadR family transcriptional regulator  50 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0024  PadR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1174  PadR family transcriptional regulator  50 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1454  PadR family transcriptional regulator  50 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0027  PadR family transcriptional regulator  50 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  34.95 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  35.4 
 
 		 131 aa  67.8  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1087  PadR-like family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5307  PadR-like family transcriptional regulator  50 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1098  PadR-like family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 181 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.216996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  36.75 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1057  PadR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  40.24 
 
 		 197 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2027  PadR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 122 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104841  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  41.86 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3525  PadR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.328828  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5137  PadR-like family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.389503  normal  0.327359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4572  PadR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4273  PadR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2546  PadR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3227  PadR-like family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.381918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3507  transcriptional regulator, PadR family  34.02 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1213  transcriptional regulator, PadR-like family  40.68 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4192  hypothetical protein  42.03 
 
 		 199 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2892  PadR-like family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 247 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1401  PadR-like family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 141 aa  62  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0038  PadR-like family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 141 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02940  predicted transcriptional regulator  36.62 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0630  transcriptional regulator, PadR-like family  36.62 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3926  transcriptional regulator PadR-like  42.03 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.171272 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02890  hypothetical protein  36.62 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3401  transcriptional regulator, PadR family  36.14 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3365  PadR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.230818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3252  PadR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>