209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1021 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 148 aa  290  7e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  44.16 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  38.39 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  31.25 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 194 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  40.7 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  33 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  35.23 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  31.25 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  30.56 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  28.21 
 
 		 250 aa  68.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  41.03 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  40.7 
 
 		 196 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  24.35 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  33.78 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  28.44 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1415  PadR-like family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3227  PadR-like family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.381918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  29.37 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  36 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  37.68 
 
 		 263 aa  64.7  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 236 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  35.9 
 
 		 316 aa  63.5  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 226 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 226 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  41.33 
 
 		 195 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 226 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1213  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1087  PadR-like family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0563  PadR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8287  transcriptional regulator protein-like protein  40 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  39.06 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1057  PadR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 181 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4355  PadR-like family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371852 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1087  PadR-like family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7443 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4572  PadR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3162  PadR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 236 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4987  PadR-like family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2892  PadR-like family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1098  PadR-like family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.216996 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3926  transcriptional regulator PadR-like  35.53 
 
 		 196 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.171272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  36.96 
 
 		 371 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5141  PadR-like family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244499  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5718  PadR-like family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86173  normal  0.252047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4521  PadR-like family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3130  PadR-like family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1127  transcriptional regulator, PadR-like family  29.92 
 
 		 209 aa  60.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  32.17 
 
 		 277 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 204 aa  60.8  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 201 aa  60.5  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0024  PadR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 235 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3678  transcriptional regulator, PadR-like family  31.91 
 
 		 238 aa  60.5  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 249 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4192  hypothetical protein  37.88 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  33.61 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5307  PadR-like family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  33.06 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0022  PadR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1530  PadR-like family regulatory protein  28.23 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3954  transcriptional regulator, PadR-like family  37.8 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.564811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0030  PadR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000428656  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0028  PadR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4067  transcriptional regulator, PadR-like family  37.8 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.690798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1401  PadR-like family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1174  PadR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1454  PadR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0027  PadR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4273  PadR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6014  PadR-like family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 325 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  25.17 
 
 		 203 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3537  PadR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.113716  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5137  PadR-like family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 254 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.389503  normal  0.327359 
 
 
-
 
NC_003296  RS03708  hypothetical protein  39.44 
 
 		 218 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  30.65 
 
 		 334 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  41.27 
 
 		 277 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1070  PadR-like family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.408045  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0411  PadR-like family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1242  PadR-like family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 218 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000724616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0619  PadR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1507  transcriptional regulator, PadR-like family  41.89 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>