194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1033 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 219 aa  426  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  50.31 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  46.58 
 
 		 250 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  48.28 
 
 		 316 aa  115  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  43.84 
 
 		 255 aa  114  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  43.05 
 
 		 277 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  41.22 
 
 		 334 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6014  PadR-like family transcriptional regulator  45.73 
 
 		 325 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  44.08 
 
 		 180 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 189 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  41.55 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  43.75 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  40.41 
 
 		 206 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  42.76 
 
 		 230 aa  98.6  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  42.47 
 
 		 251 aa  98.2  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  42.66 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4612  PadR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  39.68 
 
 		 195 aa  89.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  41.26 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0619  PadR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 305 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  35.17 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  31.72 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  32.57 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  43 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  35.06 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0411  PadR-like family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  44.3 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  33.33 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  42.31 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  36 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  40.96 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1087  PadR-like family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7443 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  34.78 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1530  PadR-like family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 159 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0038  PadR-like family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4521  PadR-like family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3009  transcriptional regulator, PadR-like  35.16 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3227  PadR-like family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.381918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5141  PadR-like family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244499  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5718  PadR-like family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86173  normal  0.252047 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3162  PadR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  34.38 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4987  PadR-like family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3130  PadR-like family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3507  transcriptional regulator, PadR family  36.84 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  29.66 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02940  predicted transcriptional regulator  36.84 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0630  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870897  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02890  hypothetical protein  36.84 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3252  PadR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3537  PadR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.113716  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4384  transcriptional regulator, PadR family  36.84 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0629  PadR-like family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3365  PadR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.230818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0868  PadR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.343891 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1070  PadR-like family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.408045  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  28.07 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  42.67 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0257  PadR-like family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 169 aa  57.8  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.688935 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0022  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1530  PadR-like family regulatory protein  37.5 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0030  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000428656  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0028  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  30 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  30 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  30 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0024  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2892  PadR-like family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1174  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1454  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0027  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3525  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.328828  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5307  PadR-like family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1371  PadR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  40.28 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1507  transcriptional regulator, PadR-like family  41.33 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2866  transcriptional regulator, PadR-like family  40.98 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0953  PadR-like family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000151261  hitchhiker  0.000286609 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4273  PadR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1409  transcriptional regulator protein  36.78 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>