297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1213 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1213  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 202 aa  391  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2649  PadR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00573866  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2382  transcriptional regulator, PadR-like family  51.55 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000270616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  53.38 
 
 		 371 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8287  transcriptional regulator protein-like protein  49.01 
 
 		 243 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3678  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 238 aa  115  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0563  PadR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 268 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  53.78 
 
 		 277 aa  111  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2892  PadR-like family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  48.89 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  47.37 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  46.34 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3401  transcriptional regulator, PadR family  44.32 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3571  PadR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.333448 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3509  PadR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000686547 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3405  transcriptional regulator, PadR family  44.32 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3475  PadR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  47.89 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  38.83 
 
 		 251 aa  75.1  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  39.58 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3525  PadR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.328828  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  43.9 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  40.24 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3507  transcriptional regulator, PadR family  40.86 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  41.56 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  45.68 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  41.89 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5307  PadR-like family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  42.68 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3162  PadR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4198  PadR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4521  PadR-like family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3365  PadR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.230818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  41.96 
 
 		 277 aa  68.2  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5141  PadR-like family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244499  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5718  PadR-like family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86173  normal  0.252047 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3130  PadR-like family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02940  predicted transcriptional regulator  41.11 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0630  transcriptional regulator, PadR-like family  41.11 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0629  PadR-like family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3252  PadR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4384  transcriptional regulator, PadR family  41.11 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4067  transcriptional regulator, PadR-like family  37.14 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.690798 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4987  PadR-like family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 237 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02890  hypothetical protein  41.11 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3954  transcriptional regulator, PadR-like family  37.14 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.564811  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2866  transcriptional regulator, PadR-like family  38.16 
 
 		 135 aa  67.4  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3537  PadR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.113716  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  38.75 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1174  PadR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1454  PadR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0027  PadR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  37.97 
 
 		 148 aa  67  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 277 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03708  hypothetical protein  35.21 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  41.03 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0022  PadR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1530  PadR-like family regulatory protein  37.93 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  44.16 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  48.61 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0030  PadR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000428656  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0028  PadR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3227  PadR-like family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.381918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  41.13 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0024  PadR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1401  PadR-like family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1409  transcriptional regulator protein  40.74 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2546  PadR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  39.44 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  48.1 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  38.82 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  41.77 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0619  PadR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  43.21 
 
 		 230 aa  62  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1087  PadR-like family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 181 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  42.5 
 
 		 271 aa  62  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4572  PadR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 191 aa  62  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  39.08 
 
 		 263 aa  62  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  39.39 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1127  transcriptional regulator, PadR-like family  41.58 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.272807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>