More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2191 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 210 aa  411  1e-114  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  63.96 
 
 		 191 aa  244  6e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1507  transcriptional regulator, PadR-like family  69.51 
 
 		 175 aa  231  8.000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  51.28 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  45.35 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 255 aa  68.2  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  43.53 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  44.3 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1213  transcriptional regulator, PadR-like family  43.48 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  45.24 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  43.37 
 
 		 113 aa  64.7  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2866  transcriptional regulator, PadR-like family  43.75 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  46.48 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 121 aa  63.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  42.5 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  41.77 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  45.12 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  46.91 
 
 		 271 aa  61.6  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  44.29 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  47.44 
 
 		 128 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  37.63 
 
 		 122 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 108 aa  60.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  37.97 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  40.7 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  33.61 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 150 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2546  PadR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1530  PadR-like family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  44.59 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6014  PadR-like family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 325 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  41.77 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  39.76 
 
 		 371 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  36.96 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1018  PadR-like family transcriptional regulator  32 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1409  transcriptional regulator protein  36.36 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  39.74 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  37 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0953  PadR-like family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000151261  hitchhiker  0.000286609 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  40.79 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  37.8 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0782  PadR-like family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.661391  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0038  PadR-like family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  43.75 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  36.47 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4521  PadR-like family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5141  PadR-like family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244499  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5718  PadR-like family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86173  normal  0.252047 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  38.2 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  36.14 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0619  PadR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3130  PadR-like family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1507  PadR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3162  PadR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4987  PadR-like family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  41.67 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2833  PadR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2519  PadR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  44.44 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  30.91 
 
 		 114 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1415  PadR-like family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 372 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  42.03 
 
 		 277 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  37.8 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1168  PadR-like family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 152 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 159 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>