More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3476 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 191 aa  384  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1507  transcriptional regulator, PadR-like family  85.55 
 
 		 175 aa  288  3e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  63.96 
 
 		 210 aa  244  4.9999999999999997e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  47.44 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  44.05 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  48 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  38.95 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  34.55 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 220 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 220 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 213 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 121 aa  63.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  37.1 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  41.79 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  29.92 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  40.23 
 
 		 217 aa  62  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  41.25 
 
 		 271 aa  62  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  34.26 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  41.89 
 
 		 250 aa  61.2  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 111 aa  60.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  34.74 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 111 aa  60.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  34.19 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  36.05 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  33.06 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  36.25 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  39.02 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1409  transcriptional regulator protein  33.33 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3227  PadR-like family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.381918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  37.08 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1530  PadR-like family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  37.65 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 316 aa  58.2  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  38.96 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  37.8 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 210 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1213  transcriptional regulator, PadR-like family  39.19 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1168  PadR-like family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2383  transcriptional regulator PadR-like  41.79 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 121 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1018  PadR-like family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 166 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2382  transcriptional regulator, PadR-like family  37.84 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000270616 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2649  PadR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00573866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0782  PadR-like family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 152 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.661391  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1507  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  39.76 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  39.47 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  34.45 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  34.09 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  31.68 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0563  PadR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  43.04 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  36.25 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  38.96 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1127  transcriptional regulator, PadR-like family  40.23 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  44.78 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  34 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 371 aa  54.7  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  38.96 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2833  PadR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2519  PadR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1415  PadR-like family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5137  PadR-like family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.389503  normal  0.327359 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0038  PadR-like family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  33.75 
 
 		 117 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4521  PadR-like family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 122 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3130  PadR-like family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 237 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 226 aa  53.9  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>