More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0360 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 107 aa  211  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  56.07 
 
 		 123 aa  124  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  58.25 
 
 		 111 aa  118  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  52.38 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  60.58 
 
 		 113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  54.37 
 
 		 116 aa  110  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  51.89 
 
 		 115 aa  109  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 111 aa  97.8  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 125 aa  94.7  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 119 aa  83.6  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  35.58 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3603  PadR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  33 
 
 		 114 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  31.43 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  35.64 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  30.69 
 
 		 110 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  31.68 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  32.69 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  39.36 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1857  PadR-like family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 110 aa  67  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3472  PadR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  37.23 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  35.48 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  38.32 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  32.67 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2527  PadR-like family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218249  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  43.96 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24890  predicted transcriptional regulator  35.11 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134259  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  31.48 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  37.38 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4325  PadR-like family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1070  transcriptional regulator, PadR-like family  36.27 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188637  hitchhiker  0.000000498444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  34.62 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  36.26 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  34.07 
 
 		 122 aa  62  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  34.07 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2361  PadR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 120 aa  62  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  32.18 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1707  PadR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.28683 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3153  PadR-like family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  28.85 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  30 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  39.81 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  36.54 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  33.02 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  36.19 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  40.59 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  28.42 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  35.29 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  35.51 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0870  transcriptional regulator, PadR-like family  27.88 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.126206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  36.89 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  26.73 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.02647e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  26.92 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  40.2 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  34.58 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09510  transcriptional regulator, PadR family  38.46 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1921  PadR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  34.58 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  39.6 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  37.25 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0913  transcriptional regulator, PadR-like family  36.19 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.197337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  34.58 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  28.3 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  34.95 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>