293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2361 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2361  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 120 aa  246  6e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  44.21 
 
 		 119 aa  84.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  46.07 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  39.39 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  46.39 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  39.78 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  43.16 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  43.16 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  41.9 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0782  transcriptional regulator, PadR-like family  36.73 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  42.42 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0435  transcriptional regulator, PadR-like family  37.86 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  42.42 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  42.55 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  39.36 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0473  transcriptional regulator PadR-like protein  40.4 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  40.78 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  41.49 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  38.1 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  40.45 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2592  transcriptional regulator, PadR-like family  45.56 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09563  hypothetical protein  38.95 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1031  transcriptional regulator, PadR-like family  39.22 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.83969  normal  0.0578877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8856  transcriptional regulator, PadR family  41.94 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  37.36 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2071  PadR-like family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  40.23 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  37.37 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  33.96 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  34.02 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  35.63 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  37.63 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  41.86 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  36.67 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  36.67 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  35.56 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3242  hypothetical protein  37.5 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.758669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3215  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3152  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3495  hypothetical protein  37.5 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3456  hypothetical protein  37.5 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  31.96 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  42.53 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  36.67 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3150  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3441  hypothetical protein  37.78 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1805  hypothetical protein  37.78 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0894  transcriptional regulator PadR-like protein  33.65 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  35.87 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3449  hypothetical protein  36.46 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000660793  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  41.49 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3470  hypothetical protein  36.46 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2172  transcriptional regulator, PadR-like family  41.11 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09510  transcriptional regulator, PadR family  38.04 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  35.87 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  35.87 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  35.87 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  35.87 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  35.87 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  35.87 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  36.63 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1680  transcriptional regulator, PadR-like family  35.56 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>