138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1175 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1175  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 113 aa  229  9e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00041601  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0295  PadR family transcriptional regulator  50 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2753  PadR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 105 aa  92  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00113864  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2734  PadR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 135 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04800  transcriptional regulator, PadR family  42.57 
 
 		 123 aa  90.9  6e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2802  hypothetical protein  43.81 
 
 		 105 aa  90.1  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.265307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3015  hypothetical protein  43.81 
 
 		 105 aa  90.1  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3051  hypothetical protein  43.81 
 
 		 105 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3013  hypothetical protein  42.86 
 
 		 105 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00968933 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3051  hypothetical protein  42.86 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.492202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2814  PadR-like family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3014  hypothetical protein  42.86 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2228  hypothetical protein  42.86 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.643872  hitchhiker  0.00000000152777 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0209  transcriptional regulator, PadR-like family  43.43 
 
 		 112 aa  88.2  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0210423 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1491  PadR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1906  transcriptional regulator, PadR-like family  39.6 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000539053 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2194  transcriptional regulator, PadR-like family  46.07 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2035  PadR-like family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17520  transcriptional regulator, PadR family  37.25 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1147  transcriptional regulator, PadR family  42 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2490  transcriptional regulator, PadR-like family  42.05 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0882  PadR-like family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1073  hypothetical protein  43.18 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0917  hypothetical protein  43.18 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0901  PadR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000161426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0885  PadR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0982  hypothetical protein  43.18 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.349108  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4283  hypothetical protein  43.18 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150167  normal  0.0390672 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2032  hypothetical protein  38.1 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3164  PadR-like family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3409  transcriptional regulator, PadR-like family  39.77 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  40.23 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2956  PadR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35110  predicted transcriptional regulator  34.69 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  34.31 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1146  transcriptional regulator, PadR-like family  37.35 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  40.23 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  34.02 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1678  transcriptional regulator, PadR-like family  36.47 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1475  transcriptional regulator, PadR-like family  36.78 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1369  transcriptional regulator, PadR-like family  34.04 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16972  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3047  PadR-like family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3679  PadR-like family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72711  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  33.66 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8548  PadR family transcriptional regulator  32 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1707  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.224855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4120  PadR-like family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  35.48 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 226 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 226 aa  50.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 226 aa  50.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 208 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 215 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 236 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  39.71 
 
 		 277 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 195 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3139  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  37.68 
 
 		 175 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  39.44 
 
 		 277 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  33.85 
 
 		 255 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  32.56 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1168  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  35.53 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  27.91 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1507  PadR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1242  PadR-like family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 218 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000724616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0782  PadR-like family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.661391  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  29.11 
 
 		 263 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  33.8 
 
 		 371 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 201 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0870  transcriptional regulator, PadR-like family  35.23 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.126206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  34.92 
 
 		 183 aa  43.9  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3472  PadR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 120 aa  43.5  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  32.93 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  30.49 
 
 		 277 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  37.93 
 
 		 222 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 230 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  37.31 
 
 		 271 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  35.38 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 204 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 372 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2546  PadR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 214 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1507  transcriptional regulator, PadR-like family  32.29 
 
 		 175 aa  41.6  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  28.92 
 
 		 112 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1409  transcriptional regulator protein  39.47 
 
 		 204 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  34.92 
 
 		 107 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>