218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1595 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1595  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  306  5e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  46 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  29.93 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1507  PadR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1168  PadR-like family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1141  transcriptional regulator, PadR-like family  27.13 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0782  PadR-like family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.661391  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  35.29 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  36.73 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1173  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3009  transcriptional regulator, PadR-like  34.07 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  34.48 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0619  PadR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 305 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 203 aa  57.4  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  31.29 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  30.51 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  34.95 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  33.72 
 
 		 250 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6014  PadR-like family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 325 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  34.07 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  37.93 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  36.19 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1530  PadR-like family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 107 aa  52.4  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 109 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  29.75 
 
 		 195 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  38.02 
 
 		 191 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  35.54 
 
 		 191 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 189 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 201 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 226 aa  51.2  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 226 aa  51.2  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 187 aa  51.2  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 226 aa  51.2  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  37.21 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1070  PadR-like family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 141 aa  50.8  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.408045  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4198  PadR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 247 aa  50.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  32.61 
 
 		 114 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  29.92 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  29.06 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1415  PadR-like family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 209 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1127  transcriptional regulator, PadR-like family  35.04 
 
 		 209 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.272807 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  39.19 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  38.04 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 114 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  38.71 
 
 		 277 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  37.35 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0067  PadR-like family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.995572  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  35.53 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  34.48 
 
 		 197 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  36.14 
 
 		 271 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  26.58 
 
 		 255 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  33.65 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  34.57 
 
 		 316 aa  48.5  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 200 aa  48.5  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 122 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0115  PadR-like family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 118 aa  48.5  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00621123  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2361  PadR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 120 aa  48.1  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  37.63 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 240 aa  47.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  34.18 
 
 		 250 aa  47.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13523  hypothetical protein  36.05 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  25.93 
 
 		 334 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 125 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3472  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  29.1 
 
 		 183 aa  47.4  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  47.17 
 
 		 205 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1327  PadR-like family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00110327  decreased coverage  0.00407043 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1213  transcriptional regulator, PadR-like family  39.19 
 
 		 202 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 114 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1401  PadR-like family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  36.25 
 
 		 203 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1409  transcriptional regulator protein  26.97 
 
 		 204 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2577  hypothetical protein  38.37 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000426616  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  37.66 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1141  transcriptional regulator, PadR family  37.21 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.386385 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  32.05 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4612  PadR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 234 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 210 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 220 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2542  hypothetical protein  37.21 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>