163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1173 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1173  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 131 aa  256  6e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1168  PadR-like family transcriptional regulator  64.12 
 
 		 152 aa  169  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1507  PadR family transcriptional regulator  63.36 
 
 		 152 aa  167  6e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0782  PadR-like family transcriptional regulator  65.08 
 
 		 152 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.661391  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1141  transcriptional regulator, PadR-like family  36.89 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  34.23 
 
 		 250 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  29.89 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  30.08 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0563  PadR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 268 aa  54.7  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1595  PadR-like family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  34.95 
 
 		 277 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  30.86 
 
 		 217 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  34.15 
 
 		 195 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  31.25 
 
 		 263 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 203 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  27.12 
 
 		 186 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3139  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 77 aa  50.8  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  32.93 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  34.15 
 
 		 113 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 201 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  35.62 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  33.33 
 
 		 250 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  34.48 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  30.84 
 
 		 226 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02940  predicted transcriptional regulator  35.37 
 
 		 207 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0630  transcriptional regulator, PadR-like family  35.37 
 
 		 207 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870897  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  34.48 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2227  PadR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3252  PadR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 207 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3537  PadR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 207 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.113716  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02890  hypothetical protein  35.37 
 
 		 207 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0629  PadR-like family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 207 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3365  PadR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 207 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.230818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3507  transcriptional regulator, PadR family  35.37 
 
 		 207 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4384  transcriptional regulator, PadR family  35.37 
 
 		 207 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 204 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0115  PadR-like family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00621123  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 213 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  33.78 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 182 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3678  transcriptional regulator, PadR-like family  45.9 
 
 		 238 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  39.62 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  45.31 
 
 		 371 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6014  PadR-like family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 325 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  26.53 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8287  transcriptional regulator protein-like protein  43.08 
 
 		 243 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0619  PadR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 305 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  32.53 
 
 		 238 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  28.43 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2892  PadR-like family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 247 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  29.63 
 
 		 277 aa  45.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5391  transcriptional regulator, PadR family  28.75 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0917422  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1507  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2202  PadR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0494  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  30.36 
 
 		 209 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  25.47 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13523  hypothetical protein  30.59 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194413 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0613  PadR-like family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  30.67 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  30.17 
 
 		 201 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 240 aa  44.3  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  35.21 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  29.59 
 
 		 190 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0067  PadR-like family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.995572  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  28.57 
 
 		 316 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1147  transcriptional regulator, PadR family  28.92 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  39.39 
 
 		 191 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  32.14 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1141  transcriptional regulator, PadR family  34.15 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.386385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3475  PadR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 214 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3405  transcriptional regulator, PadR family  31.33 
 
 		 214 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3509  PadR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 214 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000686547 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3401  transcriptional regulator, PadR family  31.33 
 
 		 214 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3571  PadR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 214 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.333448 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0917  hypothetical protein  28.05 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0885  PadR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0982  hypothetical protein  27.71 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.349108  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  35.62 
 
 		 271 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1092  PadR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 281 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0148193 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4198  PadR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 247 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 236 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5742  transcriptional regulator, PadR-like family  28.75 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  37.93 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  28.74 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>