26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0117 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



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Replicon accession
Locus tag
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Alignment on homolog gene
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Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0117  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  408  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_1531  transcriptional regulator PadR family protein  50.48 
 
 		 218 aa  204  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  34.07 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_3222  transcriptional regulator, PadR-like family  32.22 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_1446  transcriptional regulator, PadR-like family  30.73 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4202  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457407  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_1777  hypothetical protein  30.25 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354573 
 
 
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NC_012669  Bcav_3045  transcriptional regulator, PadR-like family  31.89 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0118397 
 
 
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NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  29.08 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  26.7 
 
 		 226 aa  52  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
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NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  28.65 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  26.42 
 
 		 232 aa  48.5  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  30.59 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  29.34 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 229 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
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NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 213 aa  45.1  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
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NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  27.13 
 
 		 215 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  27.27 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
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NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 242 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
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NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 183 aa  42  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 187 aa  42  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
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NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 179 aa  41.6  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 190 aa  41.2  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 199 aa  41.2  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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