142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4233 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 179 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  36.75 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  32.52 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  26.55 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  27.33 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  25.73 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  23.98 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  27.01 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  28.4 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  28.14 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  29.93 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  27.49 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  28.83 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  30.89 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 253 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  38.67 
 
 		 121 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  29.32 
 
 		 305 aa  53.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  25.29 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  34.21 
 
 		 114 aa  52.4  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8856  transcriptional regulator, PadR family  37.35 
 
 		 109 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  29.41 
 
 		 222 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  31.36 
 
 		 210 aa  51.2  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  33.33 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  36.14 
 
 		 109 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  32.11 
 
 		 128 aa  48.5  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  35.96 
 
 		 110 aa  48.5  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  21.89 
 
 		 196 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  28.69 
 
 		 325 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  23.73 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1446  transcriptional regulator, PadR-like family  23.66 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1843  PadR-like family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  30.56 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  27.78 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  23.73 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  23.73 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  35.29 
 
 		 212 aa  45.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  23.73 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 121 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  28 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  23.73 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  24.28 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  23.73 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  24.86 
 
 		 165 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  34.67 
 
 		 113 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1805  PadR-like family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 118 aa  45.1  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  32.89 
 
 		 168 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 175 aa  45.1  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  28.85 
 
 		 184 aa  45.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  34.09 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  28.95 
 
 		 107 aa  44.7  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  36.56 
 
 		 202 aa  44.7  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  25.22 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  25.22 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 114 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  25.22 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 122 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  25.22 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 229 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  25.22 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  24.35 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  24.35 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  25.22 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05950  predicted transcriptional regulator  27.78 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3449  hypothetical protein  29.49 
 
 		 106 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000660793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  24.35 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  34.69 
 
 		 114 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3215  PadR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 106 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3495  hypothetical protein  29.49 
 
 		 106 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1805  hypothetical protein  29.49 
 
 		 106 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3456  hypothetical protein  29.49 
 
 		 106 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  23.6 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>