62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05950 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_05950  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 188 aa  388  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06690  predicted transcriptional regulator  34.92 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000111873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13740  predicted transcriptional regulator  30.6 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  32.08 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  37.93 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 179 aa  51.2  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  25.97 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  25.97 
 
 		 179 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  34.29 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  29.77 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  28.18 
 
 		 187 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  26.78 
 
 		 305 aa  48.5  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1070  transcriptional regulator, PadR-like family  38.57 
 
 		 104 aa  48.5  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188637  hitchhiker  0.000000498444 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  25.32 
 
 		 179 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  30.69 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  26.17 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  28.95 
 
 		 117 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 111 aa  45.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  26.27 
 
 		 160 aa  44.7  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  27.52 
 
 		 177 aa  44.7  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  24.48 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  25.71 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  30.21 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0141  transcriptional regulator, PadR-like family  30.59 
 
 		 106 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.990112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  25.82 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 127 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0615  PadR-like family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  25 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 121 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  23.91 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2598  transcriptional regulator PadR family protein  28.74 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 110 aa  42.4  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  29.49 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 229 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 213 aa  42  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 110 aa  42  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 157 aa  42  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 113 aa  41.6  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1680  transcriptional regulator, PadR-like family  30.85 
 
 		 107 aa  41.6  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  28 
 
 		 183 aa  41.6  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4665  PadR-like family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 100 aa  41.2  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  23.89 
 
 		 212 aa  41.2  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  23.42 
 
 		 227 aa  41.2  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4772  PadR-like family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 100 aa  41.2  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0494  transcriptional regulator, PadR-like family  35.59 
 
 		 113 aa  41.2  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  32.53 
 
 		 110 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  28.41 
 
 		 165 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 110 aa  40.8  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1858  PadR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 104 aa  40.8  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000789415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>