207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1228 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1228  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 120 aa  238  2.9999999999999997e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1843  PadR-like family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 117 aa  87.4  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1805  PadR-like family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1041  PadR-like family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.812068  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  37.62 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000122824  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1228  PadR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1205  PadR family transcriptional regulator putative  35.85 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1207  PadR family transcriptional regulator putative  35.85 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0174936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1328  PadR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1403  transcriptional regulator, PadR family  35.85 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1468  transcriptional regulator, PadR family  35.85 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1366  transcriptional regulator, PadR family  35.85 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.261083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3978  transcriptional regulator, PadR family  37.37 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1229  PadR-like family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1427  PadR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0170  transcriptional regulator, PadR-like family  35.64 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0584  putative transcriptional regulator, PhaQ-like  34.91 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.02813e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0529  transcriptional regulator, PadR-like family  35.59 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  30.11 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0276  PadR-like family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00724542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0133  transcriptional regulator, PadR-like family  33.63 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  25.25 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2210  PadR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000983736  normal  0.0100315 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0311  PadR-like family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  32.35 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  32.35 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  28.26 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0980  transcriptional regulator, PadR-like family  32.53 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000128414  normal  0.0555897 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4327  transcriptional regulator, PadR-like family  37.63 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  28.57 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  26.67 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  39.74 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  27.88 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0520  PadR family transcriptional regulator  36 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2392  PadR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  35.8 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  34.57 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  26.6 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  34.57 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  25.71 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  25.96 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  34.57 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  29.67 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  30.1 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  32.05 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  37 
 
 		 277 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  28.12 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  36.56 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  35.37 
 
 		 114 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  31.73 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  37.04 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  28.97 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  25.26 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  34.65 
 
 		 109 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  36.14 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  36.25 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  30.11 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  28.24 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1205  PadR-like family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  31.91 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  29.87 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  30.53 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  28.85 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>