60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0133 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0133  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 114 aa  237  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4327  transcriptional regulator, PadR-like family  46.02 
 
 		 117 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0520  PadR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0849  PadR-like family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1031  transcriptional regulator, PadR family  38.24 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97206e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0891  PadR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0947  PadR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.720575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0845  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0857  PadR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0432305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1118  transcriptional regulator, PadR family  37.25 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  42.71 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7806  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2210  PadR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000983736  normal  0.0100315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0980  transcriptional regulator, PadR-like family  35.64 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000128414  normal  0.0555897 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0170  transcriptional regulator, PadR-like family  35.64 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1228  PadR-like family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  45.45 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000122824  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  37.36 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0276  PadR-like family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00724542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2392  PadR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  38.37 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1427  PadR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0584  putative transcriptional regulator, PhaQ-like  42.86 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.02813e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1041  PadR-like family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.812068  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1228  PadR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1205  PadR family transcriptional regulator putative  34.04 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1403  transcriptional regulator, PadR family  34.04 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1207  PadR family transcriptional regulator putative  34.04 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0174936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3978  transcriptional regulator, PadR family  34.04 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1366  transcriptional regulator, PadR family  34.04 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.261083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1468  transcriptional regulator, PadR family  34.04 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1328  PadR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1229  PadR-like family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0311  PadR-like family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  43.75 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  39.76 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1843  PadR-like family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  51.16 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2633  hypothetical protein  25.69 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.607253  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  38.16 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  36.14 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0592  transcriptional regulator, PadR-like family  40.43 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.592767  normal  0.718334 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 174 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  38.16 
 
 		 151 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  34.38 
 
 		 107 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  30 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  30.38 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0529  transcriptional regulator, PadR-like family  34.72 
 
 		 127 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2833  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2519  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  39.47 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  30.95 
 
 		 123 aa  40.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 175 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>