276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2392 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2392  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1427  PadR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1041  PadR-like family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.812068  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1228  PadR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1468  transcriptional regulator, PadR family  41.79 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1205  PadR family transcriptional regulator putative  41.79 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1207  PadR family transcriptional regulator putative  41.79 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0174936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1328  PadR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1403  transcriptional regulator, PadR family  41.79 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1366  transcriptional regulator, PadR family  41.79 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.261083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1229  PadR-like family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3978  transcriptional regulator, PadR family  41.79 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0276  PadR-like family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00724542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  42.35 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000122824  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2210  PadR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000983736  normal  0.0100315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0980  transcriptional regulator, PadR-like family  35.29 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000128414  normal  0.0555897 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0311  PadR-like family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0584  putative transcriptional regulator, PhaQ-like  36.67 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.02813e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1843  PadR-like family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  39.24 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  38.27 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  33.67 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  35.63 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  30.39 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  29.41 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  29.41 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  40.48 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  29.41 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  34.67 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1805  PadR-like family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  32.04 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  36.99 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0133  transcriptional regulator, PadR-like family  35.48 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3780  transcriptional regulator, PadR family  42.65 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0742647  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  37.18 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0170  transcriptional regulator, PadR-like family  28.85 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  28.87 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  39.73 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0520  PadR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  32.29 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1680  transcriptional regulator, PadR-like family  40.3 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  36.9 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  30 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  30.19 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  29.67 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1205  PadR-like family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1448  PadR-like family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  33.68 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2361  PadR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1228  PadR-like family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  34.62 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4327  transcriptional regulator, PadR-like family  33.68 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  32.38 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  31.58 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3449  hypothetical protein  38.24 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000660793  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0529  transcriptional regulator, PadR-like family  35.63 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3470  hypothetical protein  38.24 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124701  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1194  transcriptional regulator, PadR-like family  29.17 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 168 aa  50.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0849  PadR-like family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 113 aa  50.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3242  hypothetical protein  38.24 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.758669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2527  PadR-like family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 117 aa  50.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3215  PadR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3152  PadR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09510  transcriptional regulator, PadR family  30.34 
 
 		 107 aa  50.1  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3495  hypothetical protein  38.24 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3456  hypothetical protein  38.24 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07890  transcriptional regulator, PadR family  31.18 
 
 		 99 aa  50.1  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312386  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1031  transcriptional regulator, PadR family  27.96 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97206e-22 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2071  PadR-like family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0435  transcriptional regulator, PadR-like family  30.61 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  36.99 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2592  transcriptional regulator, PadR-like family  32.1 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8856  transcriptional regulator, PadR family  35.16 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  31.11 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  38.96 
 
 		 189 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>