76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0170 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0170  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 121 aa  243  9e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0529  transcriptional regulator, PadR-like family  51.79 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1843  PadR-like family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1228  PadR-like family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1805  PadR-like family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1229  PadR-like family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1468  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1366  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.261083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3978  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1328  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1403  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1207  PadR family transcriptional regulator putative  33.33 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0174936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1427  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1228  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1041  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.812068  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1205  PadR family transcriptional regulator putative  33.33 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  39.78 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000122824  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0133  transcriptional regulator, PadR-like family  35.64 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2392  PadR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1448  PadR-like family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0276  PadR-like family transcriptional regulator  32 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00724542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2210  PadR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000983736  normal  0.0100315 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0584  putative transcriptional regulator, PhaQ-like  34.74 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.02813e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0311  PadR-like family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4327  transcriptional regulator, PadR-like family  33.67 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0980  transcriptional regulator, PadR-like family  32.04 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000128414  normal  0.0555897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0520  PadR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  29.29 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  29.29 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  29.29 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 240 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  35.21 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0115  PadR-like family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00621123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  32.43 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  40.28 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  35.23 
 
 		 271 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  34.96 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  29.29 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1205  PadR-like family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 372 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  30 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  29.55 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  32.89 
 
 		 316 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  29.13 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  27.27 
 
 		 123 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7806  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 213 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 220 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  29.47 
 
 		 116 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 220 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  26.8 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0592  transcriptional regulator, PadR-like family  44.68 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.592767  normal  0.718334 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  38.46 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  31.71 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  28.74 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  26.42 
 
 		 128 aa  40  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>