More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1205 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1205  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 120 aa  238  2e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1448  PadR-like family transcriptional regulator  56.82 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0276  PadR-like family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00724542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2210  PadR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000983736  normal  0.0100315 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1843  PadR-like family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0311  PadR-like family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 204 aa  64.3  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  34.02 
 
 		 217 aa  63.5  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  41.41 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000122824  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1805  PadR-like family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0980  transcriptional regulator, PadR-like family  32.99 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000128414  normal  0.0555897 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2392  PadR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  34.04 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  36.46 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  38.61 
 
 		 191 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  37.84 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1228  PadR-like family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  36.59 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  39.73 
 
 		 277 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1041  PadR-like family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.812068  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  34.15 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  36.78 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1427  PadR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1229  PadR-like family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1366  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.261083  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0584  putative transcriptional regulator, PhaQ-like  31.5 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.02813e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  46.58 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3978  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1228  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1205  PadR family transcriptional regulator putative  33.33 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1207  PadR family transcriptional regulator putative  33.33 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0174936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1468  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1403  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1328  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  38.36 
 
 		 250 aa  53.9  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 203 aa  53.9  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  38.89 
 
 		 203 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3130  PadR-like family transcriptional regulator  36 
 
 		 237 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  39.33 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  39.33 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 201 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  45.59 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  32.69 
 
 		 197 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4987  PadR-like family transcriptional regulator  36 
 
 		 237 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  31.63 
 
 		 230 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  34.41 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  43.37 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  39.33 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  39.33 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3162  PadR family transcriptional regulator  36 
 
 		 236 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  39.33 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0024  PadR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 235 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  39.33 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0529  transcriptional regulator, PadR-like family  37.72 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4198  PadR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 247 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5141  PadR-like family transcriptional regulator  36 
 
 		 237 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244499  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4521  PadR-like family transcriptional regulator  36 
 
 		 237 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  33.67 
 
 		 226 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  40.45 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  40.45 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5718  PadR-like family transcriptional regulator  36 
 
 		 237 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86173  normal  0.252047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  42.31 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8287  transcriptional regulator protein-like protein  35.56 
 
 		 243 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126268  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  38.2 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  38.57 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4273  PadR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 232 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  31.48 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7806  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2892  PadR-like family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 247 aa  51.6  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  40.82 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3678  transcriptional regulator, PadR-like family  33.71 
 
 		 238 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0170  transcriptional regulator, PadR-like family  36.21 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 240 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0563  PadR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 268 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5307  PadR-like family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 250 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3227  PadR-like family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 195 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.381918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  34.29 
 
 		 263 aa  50.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  36.25 
 
 		 371 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 372 aa  50.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  33.8 
 
 		 205 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  27.45 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  34.78 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  36.25 
 
 		 183 aa  50.1  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  30.11 
 
 		 250 aa  50.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>