87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0520 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0520  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 111 aa  227  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4327  transcriptional regulator, PadR-like family  57.94 
 
 		 117 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0849  PadR-like family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 113 aa  104  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0845  transcriptional regulator  46.6 
 
 		 113 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0947  PadR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 113 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.720575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0891  PadR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 113 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1031  transcriptional regulator, PadR family  45.63 
 
 		 113 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97206e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0857  PadR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 113 aa  97.1  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0432305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1118  transcriptional regulator, PadR family  45.63 
 
 		 113 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0133  transcriptional regulator, PadR-like family  42.99 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  41.24 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7806  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2210  PadR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000983736  normal  0.0100315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0980  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000128414  normal  0.0555897 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1041  PadR-like family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.812068  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  41.18 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000122824  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1229  PadR-like family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1427  PadR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2392  PadR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1228  PadR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0276  PadR-like family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00724542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1468  transcriptional regulator, PadR family  35.11 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1366  transcriptional regulator, PadR family  35.11 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.261083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1328  PadR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3978  transcriptional regulator, PadR family  35.11 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1207  PadR family transcriptional regulator putative  35.11 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0174936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1403  transcriptional regulator, PadR family  35.11 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1205  PadR family transcriptional regulator putative  35.11 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0584  putative transcriptional regulator, PhaQ-like  36.36 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.02813e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1228  PadR-like family transcriptional regulator  36 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  31.87 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  35.9 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 105 aa  50.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0170  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  34.62 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0311  PadR-like family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 138 aa  50.1  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  32.89 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  37.33 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  37.04 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  31.11 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2081  transcriptional regulator, PadR-like family  35.14 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000022052  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  32.69 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  37.18 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  38.1 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0592  transcriptional regulator, PadR-like family  44.19 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.592767  normal  0.718334 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  35.9 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  35.37 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  32.26 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1244  transcriptional regulator, PadR-like family  31.71 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116978 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1843  PadR-like family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1963  PadR-like family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  36.14 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  30 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  27.47 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  31.25 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0870  transcriptional regulator, PadR-like family  27.08 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.126206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0529  transcriptional regulator, PadR-like family  32.67 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1805  PadR-like family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  35.44 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 114 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 110 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  33.78 
 
 		 126 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  35.14 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  34.18 
 
 		 122 aa  41.2  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 188 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  26.92 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 103 aa  40.4  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  33.77 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  27.47 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 119 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>