147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3146 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 242 aa  118  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  29.46 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  29.46 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 174 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  28.68 
 
 		 179 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  32.7 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  35.45 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  37.86 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  39 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  34.38 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  34.38 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 184 aa  62  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  30.83 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  36.46 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6303  transcriptional regulator, PadR-like family  30.93 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113883  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05950  predicted transcriptional regulator  27.42 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  27.83 
 
 		 305 aa  57  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  29.52 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  29.52 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  37.14 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  37.14 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  28.78 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  28.78 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  28.78 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  37.14 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  37.14 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4651  PadR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0244523  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2598  transcriptional regulator PadR family protein  35.06 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  35.71 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  35.71 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  35.71 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  35.71 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  29.09 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  31.03 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2505  Transcriptional regulator PadR-like protein  33.33 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.774349  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 174 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  29.91 
 
 		 232 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13740  predicted transcriptional regulator  25.6 
 
 		 196 aa  52  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  28 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  28.7 
 
 		 325 aa  51.6  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  28 
 
 		 185 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2796  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  25.36 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  27.72 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  25.76 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 119 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  27.21 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0613  transcriptional regulator, PadR-like family  30 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121754  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  30.38 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4863  transcriptional regulator, PadR-like family  29.91 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  32.43 
 
 		 123 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  24.64 
 
 		 179 aa  48.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 183 aa  48.1  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  25.74 
 
 		 174 aa  47.8  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  28.7 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  25.76 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  28.7 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  25.76 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  39.47 
 
 		 131 aa  46.6  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 255 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  30.48 
 
 		 226 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 110 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2361  PadR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 120 aa  45.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  38.57 
 
 		 125 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  30.25 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  34.25 
 
 		 107 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  30.18 
 
 		 232 aa  45.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06690  predicted transcriptional regulator  26.25 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000111873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  31.37 
 
 		 178 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 175 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  25 
 
 		 175 aa  45.1  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  31.08 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  30 
 
 		 121 aa  45.1  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  36 
 
 		 113 aa  44.7  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  35.53 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  34.78 
 
 		 119 aa  45.1  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 249 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  27.62 
 
 		 172 aa  44.7  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  35.53 
 
 		 205 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 108 aa  44.7  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 111 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>