185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2019 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 160 aa  333  9e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  41.67 
 
 		 179 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 179 aa  124  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 179 aa  123  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  44.14 
 
 		 179 aa  117  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  31.03 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 195 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  36.26 
 
 		 184 aa  70.5  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06690  predicted transcriptional regulator  33.6 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000111873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0288  PadR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0298  PadR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0279  PadR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  35.71 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  24.46 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  34.48 
 
 		 185 aa  63.9  0.0000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1362  transcriptional regulator, PadR-like family  31.63 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.323106  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0615  PadR-like family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2598  transcriptional regulator PadR family protein  28.81 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0613  transcriptional regulator, PadR-like family  27.97 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  31.15 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  38.1 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 204 aa  60.8  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  38.1 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  38.1 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  38.1 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  38.1 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  33.71 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  38.1 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4568  PadR-like family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  28.04 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  29.29 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2867  PadR-like family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  36.9 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  35.06 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13740  predicted transcriptional regulator  26.61 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  27.08 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  31.25 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6303  transcriptional regulator, PadR-like family  25 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113883  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  28.77 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2505  Transcriptional regulator PadR-like protein  25.2 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.774349  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 185 aa  53.9  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 372 aa  53.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  26.75 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  38.1 
 
 		 107 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4651  PadR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0244523  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  29.69 
 
 		 194 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  29.27 
 
 		 183 aa  52  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2796  PadR-like family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  43.4 
 
 		 110 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  43.4 
 
 		 110 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 110 aa  50.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  31.34 
 
 		 185 aa  50.4  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 176 aa  50.4  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  32.35 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2892  PadR-like family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 247 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2808  PadR-like family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1777  hypothetical protein  28.68 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4863  transcriptional regulator, PadR-like family  24.03 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  30.68 
 
 		 305 aa  48.5  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 110 aa  48.5  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  39.62 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  26.32 
 
 		 191 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  33.68 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  31.88 
 
 		 252 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  31.08 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4772  PadR-like family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4665  PadR-like family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  25.51 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  37.74 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  39.68 
 
 		 371 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  23.08 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1371  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0218081  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  43.55 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  29.17 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07680  predicted transcriptional regulator  32.14 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2392  PadR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  31.51 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  25.58 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  24.43 
 
 		 202 aa  45.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8287  transcriptional regulator protein-like protein  31.34 
 
 		 243 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126268  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>