176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5624 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 191 aa  390  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4729  transcriptional regulator, PadR-like family  35.64 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  48.08 
 
 		 198 aa  88.2  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3646  transcriptional regulator, PadR-like family  33.7 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  38.61 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  30.17 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  33 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  33.07 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  40.48 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  30.67 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  31 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  28.77 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  32.69 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  30.47 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  33.64 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  27.87 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  44.59 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  27.87 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  28.66 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  44.44 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  33.33 
 
 		 168 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  36.47 
 
 		 316 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  27.35 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  35.58 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  31.31 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  35.92 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  34.34 
 
 		 252 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  41.89 
 
 		 255 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 174 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4806  transcriptional regulator, PadR-like family  35.51 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  27.62 
 
 		 305 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05461  hypothetical protein  27.87 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.144264 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  27.93 
 
 		 174 aa  52  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 174 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 183 aa  51.6  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  44.44 
 
 		 251 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  32.69 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4476  PadR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 168 aa  51.2  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 220 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 220 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  33.65 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  41.1 
 
 		 263 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  49.02 
 
 		 250 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  28.81 
 
 		 325 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1562  transcriptional regulator, PadR-like family  31.93 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  30.84 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 277 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1924  PadR-like family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000157099 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  23.91 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  38.16 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  28 
 
 		 177 aa  49.3  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 174 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  44.23 
 
 		 334 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  47.06 
 
 		 271 aa  47.8  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6303  transcriptional regulator, PadR-like family  23.48 
 
 		 188 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113883  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  37.93 
 
 		 238 aa  48.1  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  39.13 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  35.53 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  37.33 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  42.11 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  36.62 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4863  transcriptional regulator, PadR-like family  30.16 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  40.54 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1958  transcriptional regulator, PadR-like family  36.96 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  42.47 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  35.62 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  29.91 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  36.14 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  30.33 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  36.49 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>