39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1958 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1958  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1562  transcriptional regulator, PadR-like family  46.28 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3646  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  35.96 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4729  transcriptional regulator, PadR-like family  26 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  27.09 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  38.2 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  36.56 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  37.11 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  26.98 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  39.58 
 
 		 249 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  32.26 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  34 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  34 
 
 		 190 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  32 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  32 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  36.96 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 134 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  27.03 
 
 		 177 aa  45.1  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  27.37 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  25.13 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1371  transcriptional regulator, PadR-like family  26.49 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0218081  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  34.29 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  31.43 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0471  integrase family protein  45.45 
 
 		 398 aa  42.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116709  hitchhiker  0.000616461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  26.37 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  32.98 
 
 		 184 aa  42  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0057  transcriptional regulator, PadR-like family  28.19 
 
 		 168 aa  42  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 179 aa  42  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>