77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3646 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3646  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 199 aa  400  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4729  transcriptional regulator, PadR-like family  39.13 
 
 		 197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  33.7 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  40.35 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1958  transcriptional regulator, PadR-like family  28.16 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1562  transcriptional regulator, PadR-like family  34.58 
 
 		 186 aa  62  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  28.5 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  28.65 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  24.71 
 
 		 168 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  28.57 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 179 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4806  transcriptional regulator, PadR-like family  26.92 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 174 aa  52  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  26.09 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  26.37 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  23.33 
 
 		 179 aa  51.2  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  33.94 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  37.36 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  29.94 
 
 		 232 aa  49.3  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  27.07 
 
 		 181 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  26.72 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  26.72 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  25.95 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  37.78 
 
 		 172 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 179 aa  48.5  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  27.47 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  30.19 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1031  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 116 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.83969  normal  0.0578877 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4476  PadR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  32.73 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  32.38 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  22.99 
 
 		 183 aa  44.7  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  32.95 
 
 		 227 aa  44.7  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  21.35 
 
 		 183 aa  44.7  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  38.37 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  31.46 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  35.63 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  27.62 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 173 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  30.46 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  25 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  27.62 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  32.14 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  34.12 
 
 		 252 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  24.73 
 
 		 242 aa  42.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  20.32 
 
 		 305 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  33.03 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  30.48 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  30.48 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  25.65 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  28.32 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  33.65 
 
 		 109 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 185 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05461  hypothetical protein  25.95 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.144264 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  32.14 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 203 aa  42  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8856  transcriptional regulator, PadR family  32.04 
 
 		 109 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  25 
 
 		 216 aa  42  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0057  transcriptional regulator, PadR-like family  28.41 
 
 		 168 aa  42  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  26.06 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  42.5 
 
 		 128 aa  41.6  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  30.84 
 
 		 199 aa  41.6  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  25.52 
 
 		 184 aa  41.6  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1921  PadR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 114 aa  41.6  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 124 aa  41.2  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  35.87 
 
 		 209 aa  41.6  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>