93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3569 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3569  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 109 aa  219  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1666  transcriptional regulator, PadR-like family  59.63 
 
 		 109 aa  144  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1476  transcriptional regulator, PadR-like family  54.46 
 
 		 109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3490  transcriptional regulator, PadR-like family  44.76 
 
 		 108 aa  99.4  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5040  PadR-like family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 113 aa  88.2  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5372  transcriptional regulator, PadR-like family  47.06 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2803  transcriptional regulator, PadR-like family  41.18 
 
 		 101 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  44.74 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  45.31 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3190  transcriptional regulator, PadR-like family  38.24 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0392978  normal  0.0453755 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0473  transcriptional regulator PadR-like protein  40 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  55.81 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  35.23 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  48.89 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0435  transcriptional regulator, PadR-like family  36.11 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  43.75 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09563  hypothetical protein  38.36 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2592  transcriptional regulator, PadR-like family  41.46 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  41.54 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000122824  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1475  transcriptional regulator, PadR-like family  31.03 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  32.35 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  34.78 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  46.51 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  28.74 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_710  transcriptional regulator, PadR-type  48.94 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0242268  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  44.44 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  41.54 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4803  transcriptional regulator, PadR family  35.85 
 
 		 86 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  35.56 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  51.11 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  41.79 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  44.9 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5391  transcriptional regulator, PadR family  36.84 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0917422  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3107  transcriptional regulator, PadR-like family  30.97 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 119 aa  43.5  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  36.76 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0734  hypothetical protein  36.76 
 
 		 118 aa  42  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  37.33 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35110  predicted transcriptional regulator  29.57 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0494  transcriptional regulator, PadR-like family  33.94 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4325  PadR-like family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0894  transcriptional regulator PadR-like protein  29.21 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1070  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188637  hitchhiker  0.000000498444 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 109 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  44.07 
 
 		 114 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 109 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  32.22 
 
 		 114 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  46.81 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2833  PadR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 146 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2519  PadR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 146 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  37.68 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  31.82 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  37.1 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  46.77 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1858  PadR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000789415  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  45.28 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1798  PadR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0304108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3696  PadR-like family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2527  PadR-like family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218249  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4507  PadR-like family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.718023  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3488  transcriptional regulator, PadR family  33.87 
 
 		 109 aa  40  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00705716  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  33.78 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3469  hypothetical protein  33.87 
 
 		 109 aa  40  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0557218  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0782  transcriptional regulator, PadR-like family  35.29 
 
 		 108 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2361  PadR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 120 aa  40  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>