183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_710 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_710  transcriptional regulator, PadR-type  100 
 
 		 99 aa  203  6e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0242268  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0730  PadR family transcriptional regulator  92.86 
 
 		 99 aa  189  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.118827  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0613  PadR-like family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 101 aa  114  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2202  PadR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 102 aa  100  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4437  transcriptional regulator, PadR-like family  46.32 
 
 		 97 aa  96.3  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.873187 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1141  transcriptional regulator, PadR family  43.3 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.386385 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2348  PadR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203957  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2060  PadR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2227  PadR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 101 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13523  hypothetical protein  47.37 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194413 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3107  transcriptional regulator, PadR-like family  46.94 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1435  PadR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.666797 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0216  PadR-like family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1225  PadR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 100 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2857  transcriptional regulator, PadR-like family  44.9 
 
 		 100 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.748004 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2687  PadR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4772  PadR-like family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4665  PadR-like family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  31 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  34.74 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  42.11 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  38.2 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  37.89 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2527  PadR-like family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 117 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  36.59 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  36.59 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  36.59 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1070  transcriptional regulator, PadR-like family  31.91 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188637  hitchhiker  0.000000498444 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 372 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04310  transcriptional regulator, PadR family  32.47 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3696  PadR-like family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0734  hypothetical protein  34.72 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0681  transcriptional regulator, PadR-like family  34.72 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  35.23 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0660  PadR-like family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0691  PadR-like family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1244  transcriptional regulator, PadR-like family  41.67 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116978 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  35.16 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4235  transcriptional regulator, PadR family  34.72 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324298  normal  0.0938031 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 188 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  30.48 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0690  PadR-like family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  34.48 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  34.48 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  39.06 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1798  PadR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0304108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  36.05 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1858  PadR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000789415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  30.53 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  39.02 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5391  transcriptional regulator, PadR family  31.58 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0917422  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0318  PadR family transcriptional regulator  46 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.490678  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0494  transcriptional regulator, PadR-like family  32.89 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 108 aa  50.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  34.69 
 
 		 112 aa  50.4  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 117 aa  50.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5527  PadR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  29.47 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  30.95 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  30.95 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  30.95 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  30.95 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  30.95 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4325  PadR-like family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5742  transcriptional regulator, PadR-like family  33.8 
 
 		 112 aa  48.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  37.8 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 111 aa  48.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  32.18 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  29.79 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1270  PadR-like family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169455  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5749  putative PadR-like family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1018  PadR-like family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  41.94 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  35.37 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>