187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1435 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1435  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 128 aa  254  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.666797 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13523  hypothetical protein  75 
 
 		 107 aa  158  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4437  transcriptional regulator, PadR-like family  71.88 
 
 		 97 aa  139  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.873187 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2202  PadR family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1141  transcriptional regulator, PadR family  46.32 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.386385 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0613  PadR-like family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 101 aa  102  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0216  PadR-like family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 92 aa  100  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3107  transcriptional regulator, PadR-like family  55.79 
 
 		 103 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2348  PadR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203957  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2060  PadR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4772  PadR-like family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4665  PadR-like family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0730  PadR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 99 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.118827  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_710  transcriptional regulator, PadR-type  48.42 
 
 		 99 aa  92  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0242268  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2227  PadR family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1225  PadR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 100 aa  83.6  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2857  transcriptional regulator, PadR-like family  44.21 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.748004 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2687  PadR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  36.45 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  37.21 
 
 		 115 aa  60.1  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  39.74 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  32.63 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2527  PadR-like family transcriptional regulator  37 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218249  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  41.46 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2592  transcriptional regulator, PadR-like family  41.3 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  33.98 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  33.98 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4325  PadR-like family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405564  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  34.74 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  39.74 
 
 		 263 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  35.37 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04310  transcriptional regulator, PadR family  34.19 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  33.01 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3678  transcriptional regulator, PadR-like family  39.53 
 
 		 238 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  38.27 
 
 		 195 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5749  putative PadR-like family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  32.98 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  33.65 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  37.66 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3772  transcriptional regulator, PadR-like family  32.26 
 
 		 124 aa  50.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5527  PadR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  39.36 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  32.04 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  30.68 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0318  PadR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.490678  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  35.35 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0563  PadR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 268 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  35.8 
 
 		 109 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  38.16 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  42.67 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  35.64 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2892  PadR-like family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 247 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  52.63 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  34.07 
 
 		 135 aa  47.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  30.21 
 
 		 111 aa  47.4  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1798  PadR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0304108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0522  PadR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  37.93 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  39.08 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  37.35 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 118 aa  47  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  29.35 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  43.33 
 
 		 371 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3696  PadR-like family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  35.05 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0247  PadR-like family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.917894 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  38.55 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  32.14 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  36.9 
 
 		 195 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  34.57 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8287  transcriptional regulator protein-like protein  37.04 
 
 		 243 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  31.65 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>