61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0298 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_0298  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 248 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0288  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 248 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0279  PadR family transcriptional regulator  99.55 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4568  PadR-like family transcriptional regulator  62.04 
 
 		 227 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2867  PadR-like family transcriptional regulator  58.77 
 
 		 215 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1362  transcriptional regulator, PadR-like family  51.67 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.323106  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0615  PadR-like family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  35.16 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  33.9 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3145  PadR-like family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  35.14 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  35.54 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  39 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  29.95 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  27.78 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  34.29 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  37.93 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  32 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 187 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  34.31 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1177  transcriptional regulator, PadR-like family  31.25 
 
 		 186 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0592255  hitchhiker  0.00870551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  36.78 
 
 		 179 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  30.51 
 
 		 179 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  28.49 
 
 		 325 aa  52.4  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 183 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 179 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  32.39 
 
 		 177 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  30.51 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  29.06 
 
 		 179 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 174 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 168 aa  50.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  31.97 
 
 		 172 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  27.98 
 
 		 190 aa  49.3  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4863  transcriptional regulator, PadR-like family  30.3 
 
 		 186 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  36.84 
 
 		 181 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  29.2 
 
 		 168 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  39.02 
 
 		 174 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2598  transcriptional regulator PadR family protein  33.61 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13740  predicted transcriptional regulator  31.33 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4651  PadR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 191 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0244523  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 179 aa  45.4  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 187 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 176 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2210  PadR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 136 aa  43.9  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000983736  normal  0.0100315 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5605  PadR-like family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0554701  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0916  PadR-like family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 171 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 183 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  31.06 
 
 		 174 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0115  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 118 aa  42.4  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00621123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>