85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0916 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0916  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 171 aa  348  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0979  transcriptional regulator PadR family protein  96.49 
 
 		 191 aa  338  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1864  hypothetical protein  54.79 
 
 		 148 aa  157  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00461724  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0943  transcriptional regulator, PadR-like family  45.81 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  38.65 
 
 		 190 aa  125  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07680  predicted transcriptional regulator  45.7 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4863  transcriptional regulator, PadR-like family  36.65 
 
 		 186 aa  114  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 204 aa  70.9  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0615  PadR-like family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 187 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  34.59 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  36.28 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  32.32 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  30.53 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  30.23 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  34.65 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 184 aa  57.4  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3145  PadR-like family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  24.55 
 
 		 325 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 183 aa  52  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 179 aa  51.6  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  34.34 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  27.61 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1561  transcriptional regulator, PadR-like family  30.61 
 
 		 187 aa  47.8  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4476  PadR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  24.54 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  32.63 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  24.54 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  27.05 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  27.04 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  25.47 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  29.03 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  29.47 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4824  transcriptional regulator, PadR-like family  34.02 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4568  PadR-like family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 227 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1562  transcriptional regulator, PadR-like family  33 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 216 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  25 
 
 		 305 aa  45.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  34.04 
 
 		 210 aa  45.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 181 aa  45.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 202 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3907  PadR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 207 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 202 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  25.6 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  26.53 
 
 		 179 aa  44.7  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  29.27 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  30.56 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  25.41 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0279  PadR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  26.53 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  28.12 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0288  PadR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 248 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0298  PadR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 248 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2808  PadR-like family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  25.45 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  45.61 
 
 		 277 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  25.45 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  30.49 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05461  hypothetical protein  24.07 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.144264 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  29.27 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  35.53 
 
 		 180 aa  42.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2867  PadR-like family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  26.56 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4271  PadR-like family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0469605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5605  PadR-like family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 207 aa  41.6  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0554701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  22.02 
 
 		 179 aa  41.2  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 213 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  30.06 
 
 		 177 aa  40.8  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 220 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 220 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  28.66 
 
 		 174 aa  40.8  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>