47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1864 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1864  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  307  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00461724  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0916  PadR-like family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 171 aa  168  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0979  transcriptional regulator PadR family protein  54.79 
 
 		 191 aa  169  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0943  transcriptional regulator, PadR-like family  43.45 
 
 		 166 aa  110  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07680  predicted transcriptional regulator  39.58 
 
 		 166 aa  107  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  35.86 
 
 		 190 aa  96.7  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4863  transcriptional regulator, PadR-like family  32.39 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4476  PadR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  28 
 
 		 173 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  24.49 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  24.49 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 204 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  29.09 
 
 		 185 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05461  hypothetical protein  28.97 
 
 		 178 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.144264 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0615  PadR-like family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 212 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 196 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 185 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  28.18 
 
 		 196 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  21.15 
 
 		 216 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4271  PadR-like family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 179 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0469605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  26 
 
 		 187 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 195 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  25.64 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  30.86 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 182 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  31.07 
 
 		 172 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  30.86 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  36.36 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13740  predicted transcriptional regulator  25.5 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  27.91 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  34.72 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 176 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  27.43 
 
 		 194 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4568  PadR-like family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 227 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  24.19 
 
 		 183 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4824  transcriptional regulator, PadR-like family  28.92 
 
 		 184 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>