63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4568 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4568  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  456  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0298  PadR family transcriptional regulator  62.04 
 
 		 248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0288  PadR family transcriptional regulator  62.04 
 
 		 248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0279  PadR family transcriptional regulator  62.04 
 
 		 221 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2867  PadR-like family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 215 aa  246  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1362  transcriptional regulator, PadR-like family  49.15 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.323106  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0615  PadR-like family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 212 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  30.14 
 
 		 179 aa  67.8  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  34.23 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3145  PadR-like family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  32.97 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  33.14 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  28.48 
 
 		 179 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 173 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 183 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 202 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 202 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 187 aa  52  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 174 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  24.08 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  29.29 
 
 		 179 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  27.56 
 
 		 305 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  30.23 
 
 		 325 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 183 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 179 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 179 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  29.2 
 
 		 177 aa  48.9  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  30.64 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  31.45 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4476  PadR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  28.85 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0979  transcriptional regulator PadR family protein  32.04 
 
 		 191 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  31.33 
 
 		 184 aa  46.6  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1177  transcriptional regulator, PadR-like family  28.04 
 
 		 186 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0592255  hitchhiker  0.00870551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2598  transcriptional regulator PadR family protein  33.66 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  27.78 
 
 		 174 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0916  PadR-like family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 171 aa  45.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5605  PadR-like family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 207 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0554701  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  30 
 
 		 179 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  39.24 
 
 		 174 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  29.35 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  32.8 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06690  predicted transcriptional regulator  31.82 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000111873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 176 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05461  hypothetical protein  29.5 
 
 		 178 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.144264 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3673  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 189 aa  42.4  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  40.91 
 
 		 129 aa  42.4  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000122824  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2210  PadR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 136 aa  42  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000983736  normal  0.0100315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 174 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 179 aa  42  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 195 aa  42  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 372 aa  42  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  32.61 
 
 		 178 aa  41.6  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4271  PadR-like family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 179 aa  41.6  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0469605  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>