72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2808 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2808  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 180 aa  362  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  34.29 
 
 		 179 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  29.59 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  29.12 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  24.57 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  24.57 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  24.46 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  29.31 
 
 		 325 aa  58.2  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  27.12 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  29.59 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  25.56 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  34.17 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  25.93 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  23.49 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  27.27 
 
 		 187 aa  51.6  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  25.84 
 
 		 305 aa  51.2  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  29.73 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  32.97 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  25.45 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06690  predicted transcriptional regulator  22.64 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000111873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  26.37 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  24.58 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  25 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  22.54 
 
 		 184 aa  48.5  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3145  PadR-like family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 184 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  26.86 
 
 		 174 aa  47.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  26.7 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  27.59 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  26.09 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  23.68 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  30.43 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5605  PadR-like family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 207 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0554701  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 173 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  28.12 
 
 		 191 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  23.97 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  22.22 
 
 		 179 aa  44.7  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  22.22 
 
 		 179 aa  44.7  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 181 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1177  transcriptional regulator, PadR-like family  30 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0592255  hitchhiker  0.00870551 
 
 
-
 
NC_003296  RS05461  hypothetical protein  24.44 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.144264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1362  transcriptional regulator, PadR-like family  29.41 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.323106  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  25.15 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0916  PadR-like family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  26.5 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 210 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 152 aa  42  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  29.79 
 
 		 212 aa  42  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0979  transcriptional regulator PadR family protein  23.31 
 
 		 191 aa  42  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  22.48 
 
 		 172 aa  41.6  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 184 aa  41.2  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 179 aa  41.2  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4824  transcriptional regulator, PadR-like family  22.65 
 
 		 184 aa  40.8  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>