34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2198 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2198  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 91 aa  184  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2941  transcriptional regulator, PadR-like family  91.11 
 
 		 91 aa  167  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.245813  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2210  transcriptional regulator, PadR-like family  90 
 
 		 92 aa  166  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0780197  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1693  transcriptional regulator, PadR-like family  88.89 
 
 		 91 aa  165  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2296  transcriptional regulator, PadR-like family  87.78 
 
 		 91 aa  163  8e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.61746  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2749  transcriptional regulator, PadR-like family  83.15 
 
 		 91 aa  160  5.0000000000000005e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  82.22 
 
 		 91 aa  157  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4776  transcriptional regulator, PadR-like family  83.33 
 
 		 92 aa  156  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4915  transcriptional regulator, PadR-like family  83.15 
 
 		 97 aa  156  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3614  transcriptional regulator, PadR-like family  80.9 
 
 		 93 aa  151  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4072  transcriptional regulator, PadR-like family  80.9 
 
 		 95 aa  151  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3008  transcriptional regulator, PadR-like family  72.22 
 
 		 91 aa  137  6e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0934248  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0429  transcriptional regulator, PadR-like family  67.78 
 
 		 90 aa  130  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5176  transcriptional regulator, PadR-like family  68.89 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.221427  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2257  transcriptional regulator, PadR-like family  68.89 
 
 		 91 aa  128  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4825  transcriptional regulator, PadR-like family  67.78 
 
 		 90 aa  127  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4837  transcriptional regulator, PadR-like family  65.56 
 
 		 91 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4053  transcriptional regulator, PadR-like family  65.56 
 
 		 91 aa  121  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0723  transcriptional regulator, PadR-like family  65.56 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2671  transcriptional regulator, PadR-like family  65.56 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.338912  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5079  transcriptional regulator, PadR-like family  61.36 
 
 		 105 aa  114  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0854427  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4611  transcriptional regulator, PadR-like family  67.78 
 
 		 91 aa  112  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3648  transcriptional regulator, PadR-like family  59.34 
 
 		 99 aa  110  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3619  transcriptional regulator, PadR-like family  56.82 
 
 		 110 aa  110  9e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3315  transcriptional regulator, PadR-like family  55.81 
 
 		 97 aa  103  9e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4967  transcriptional regulator, PadR-like family  63.64 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.598171  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0305  transcriptional regulator, PadR-like family  53.66 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.867238  normal  0.137028 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3064  transcriptional regulator, PadR-like family  53.01 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2589  transcriptional regulator, PadR-like family  54.22 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0311  transcriptional regulator, PadR-like family  60.27 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4301  transcriptional regulator, PadR-like family  47.37 
 
 		 173 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202293  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1205  transcriptional regulator, PadR-like family  48.19 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2947  transcriptional regulator, PadR-like family  44.19 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.260614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2907  transcriptional regulator, PadR-like family  29.07 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0960703  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>