34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4915 on replicon NC_013746
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013746  Htur_4915  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 97 aa  197  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2210  transcriptional regulator, PadR-like family  85.39 
 
 		 92 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0780197  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2941  transcriptional regulator, PadR-like family  85.39 
 
 		 91 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.245813  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2296  transcriptional regulator, PadR-like family  85.39 
 
 		 91 aa  161  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.61746  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4072  transcriptional regulator, PadR-like family  78.95 
 
 		 95 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1693  transcriptional regulator, PadR-like family  84.27 
 
 		 91 aa  160  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3614  transcriptional regulator, PadR-like family  79.57 
 
 		 93 aa  159  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4776  transcriptional regulator, PadR-like family  83.15 
 
 		 92 aa  159  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2198  transcriptional regulator, PadR-like family  83.15 
 
 		 91 aa  156  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  79.78 
 
 		 91 aa  152  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2749  transcriptional regulator, PadR-like family  74.44 
 
 		 91 aa  150  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3008  transcriptional regulator, PadR-like family  66.29 
 
 		 91 aa  130  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0934248  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5176  transcriptional regulator, PadR-like family  65.17 
 
 		 91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.221427  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2257  transcriptional regulator, PadR-like family  67.42 
 
 		 91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4837  transcriptional regulator, PadR-like family  64.04 
 
 		 91 aa  127  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0429  transcriptional regulator, PadR-like family  64.04 
 
 		 90 aa  126  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4825  transcriptional regulator, PadR-like family  64.04 
 
 		 90 aa  123  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4053  transcriptional regulator, PadR-like family  65.17 
 
 		 91 aa  123  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3648  transcriptional regulator, PadR-like family  58.7 
 
 		 99 aa  113  8.999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0723  transcriptional regulator, PadR-like family  56.18 
 
 		 91 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3619  transcriptional regulator, PadR-like family  52.17 
 
 		 110 aa  110  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2671  transcriptional regulator, PadR-like family  55.06 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.338912  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4611  transcriptional regulator, PadR-like family  64.44 
 
 		 91 aa  107  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4967  transcriptional regulator, PadR-like family  66.67 
 
 		 78 aa  106  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.598171  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5079  transcriptional regulator, PadR-like family  55.42 
 
 		 105 aa  100  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0854427  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3315  transcriptional regulator, PadR-like family  51.76 
 
 		 97 aa  97.8  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0305  transcriptional regulator, PadR-like family  51.11 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.867238  normal  0.137028 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0311  transcriptional regulator, PadR-like family  53.66 
 
 		 119 aa  88.6  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2589  transcriptional regulator, PadR-like family  59.72 
 
 		 119 aa  88.2  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3064  transcriptional regulator, PadR-like family  50.6 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4301  transcriptional regulator, PadR-like family  40.78 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202293  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1205  transcriptional regulator, PadR-like family  45.78 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2947  transcriptional regulator, PadR-like family  38.71 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.260614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>