36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5079 on replicon NC_013748
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013748  Htur_5079  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 105 aa  215  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0854427  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2749  transcriptional regulator, PadR-like family  63.53 
 
 		 91 aa  116  9e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2198  transcriptional regulator, PadR-like family  61.36 
 
 		 91 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2941  transcriptional regulator, PadR-like family  60.23 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.245813  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2210  transcriptional regulator, PadR-like family  61.36 
 
 		 92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0780197  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1693  transcriptional regulator, PadR-like family  61.36 
 
 		 91 aa  111  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2296  transcriptional regulator, PadR-like family  60.23 
 
 		 91 aa  110  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.61746  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3008  transcriptional regulator, PadR-like family  57.95 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0934248  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  56.82 
 
 		 91 aa  107  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0429  transcriptional regulator, PadR-like family  55.68 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2257  transcriptional regulator, PadR-like family  55.68 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4825  transcriptional regulator, PadR-like family  54.55 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4776  transcriptional regulator, PadR-like family  56.82 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3614  transcriptional regulator, PadR-like family  57.65 
 
 		 93 aa  105  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5176  transcriptional regulator, PadR-like family  53.93 
 
 		 91 aa  103  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.221427  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4837  transcriptional regulator, PadR-like family  52.27 
 
 		 91 aa  102  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4915  transcriptional regulator, PadR-like family  55.42 
 
 		 97 aa  100  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4072  transcriptional regulator, PadR-like family  56.63 
 
 		 95 aa  100  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3315  transcriptional regulator, PadR-like family  50.57 
 
 		 97 aa  99.4  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4053  transcriptional regulator, PadR-like family  51.14 
 
 		 91 aa  98.6  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3648  transcriptional regulator, PadR-like family  53.41 
 
 		 99 aa  97.4  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0305  transcriptional regulator, PadR-like family  47.12 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.867238  normal  0.137028 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2671  transcriptional regulator, PadR-like family  52.27 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.338912  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3064  transcriptional regulator, PadR-like family  47.06 
 
 		 119 aa  94.4  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3619  transcriptional regulator, PadR-like family  52.94 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0723  transcriptional regulator, PadR-like family  52.27 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1205  transcriptional regulator, PadR-like family  48.42 
 
 		 119 aa  88.2  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4611  transcriptional regulator, PadR-like family  57.35 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0311  transcriptional regulator, PadR-like family  43.69 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2589  transcriptional regulator, PadR-like family  51.85 
 
 		 119 aa  83.6  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4967  transcriptional regulator, PadR-like family  52.78 
 
 		 78 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.598171  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4301  transcriptional regulator, PadR-like family  44.09 
 
 		 173 aa  73.6  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202293  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2947  transcriptional regulator, PadR-like family  37.65 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.260614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2066  transcriptional regulator, PadR-like family  32.61 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0383974  normal  0.155054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  34.67 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>