32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0141 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0141  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 106 aa  215  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.990112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0940  transcriptional regulator, PadR-like family  70.75 
 
 		 108 aa  159  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.795743  normal  0.552742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0949  transcriptional regulator, PadR-like family  61.32 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0933  transcriptional regulator, PadR-like family  60.19 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3773  transcriptional regulator, PadR-like family  56.6 
 
 		 111 aa  133  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2205  transcriptional regulator, PadR-like family  59.22 
 
 		 108 aa  131  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3313  transcriptional regulator, PadR-like family  55.34 
 
 		 119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0945  transcriptional regulator, PadR-like family  55.24 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4620  transcriptional regulator, PadR-like family  54.37 
 
 		 112 aa  120  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.320859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0924  transcriptional regulator, PadR-like family  54.37 
 
 		 112 aa  120  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240063  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0930  transcriptional regulator, PadR-like family  54.9 
 
 		 111 aa  116  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1759  transcriptional regulator, PadR-like family  51.46 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3135  transcriptional regulator, PadR-like family  56.86 
 
 		 117 aa  114  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1557  transcriptional regulator, PadR-like family  53.4 
 
 		 111 aa  110  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2082  transcriptional regulator, PadR-like family  53.7 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1451  transcriptional regulator, PadR-like family  56.31 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2157  transcriptional regulator, PadR-like family  48.81 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05950  predicted transcriptional regulator  30.59 
 
 		 188 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  32.29 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  29.41 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  32.86 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2361  PadR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  31.25 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  30.95 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  32.1 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  32.31 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  29.59 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1435  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 128 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.666797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>