23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1759 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1759  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 120 aa  244  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1557  transcriptional regulator, PadR-like family  79.28 
 
 		 111 aa  185  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3773  transcriptional regulator, PadR-like family  57.28 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0141  transcriptional regulator, PadR-like family  51.46 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.990112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0949  transcriptional regulator, PadR-like family  55.88 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0933  transcriptional regulator, PadR-like family  51.85 
 
 		 112 aa  115  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0940  transcriptional regulator, PadR-like family  55.34 
 
 		 108 aa  114  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.795743  normal  0.552742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0945  transcriptional regulator, PadR-like family  51.4 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3135  transcriptional regulator, PadR-like family  52.88 
 
 		 117 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4620  transcriptional regulator, PadR-like family  48.15 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.320859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3313  transcriptional regulator, PadR-like family  53.4 
 
 		 119 aa  107  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0924  transcriptional regulator, PadR-like family  48.15 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240063  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0930  transcriptional regulator, PadR-like family  49.04 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2205  transcriptional regulator, PadR-like family  47.66 
 
 		 108 aa  98.6  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1451  transcriptional regulator, PadR-like family  50.93 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2082  transcriptional regulator, PadR-like family  47.17 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2157  transcriptional regulator, PadR-like family  39.53 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  29.59 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
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NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  36.62 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 110 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  31.46 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  30.12 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
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